Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc89Q9DA73 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc89Q9DA73 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc89Q9DA73 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc89Q9DA73 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc89Q9DA73 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc89Q9DA73 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc89Q9DA73 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc89Q9DA73 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc89Q9DA73 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc89Q9DA73 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc89Q9DA73 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc89Q9DA73 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc89Q9DA73 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc89Q9DA73 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc89Q9DA73 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc89Q9DA73 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc89Q9DA73 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc89Q9DA73 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc89Q9DA73 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc89Q9DA73 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc89Q9DA73 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc89Q9DA73 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc89Q9DA73 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc89Q9DA73 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc89Q9DA73 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc89Q9DA73 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc89Q9DA73 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc89Q9DA73 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc89Q9DA73 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc89Q9DA73 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc89Q9DA73 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc89Q9DA73 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc89Q9DA73 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc89Q9DA73 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc89Q9DA73 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc89Q9DA73 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc89Q9DA73 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc89Q9DA73 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc89Q9DA73 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc89Q9DA73 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc89Q9DA73 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc89Q9DA73 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc89Q9DA73 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc89Q9DA73 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc89Q9DA73 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc89Q9DA73 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc89Q9DA73 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc89Q9DA73 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc89Q9DA73 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc89Q9DA73 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc89Q9DA73 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc89Q9DA73 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc89Q9DA73 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc89Q9DA73 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc89Q9DA73 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc89Q9DA73 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc89Q9DA73 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc89Q9DA73 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc89Q9DA73 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc89Q9DA73 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc89Q9DA73 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc89Q9DA73 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc89Q9DA73 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc89Q9DA73 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc89Q9DA73 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc89Q9DA73 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc89Q9DA73 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc89Q9DA73 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc89Q9DA73 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc89Q9DA73 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc89Q9DA73 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc89Q9DA73 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc89Q9DA73 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc89Q9DA73 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc89Q9DA73 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc89Q9DA73 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc89Q9DA73 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc89Q9DA73 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc89Q9DA73 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc89Q9DA73 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc89Q9DA73 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc89Q9DA73 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc89Q9DA73 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc89Q9DA73 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc89Q9DA73 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc89Q9DA73 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc89Q9DA73 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc89Q9DA73 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc89Q9DA73 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc89Q9DA73 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc89Q9DA73 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc89Q9DA73 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc89Q9DA73 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc89Q9DA73 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc89Q9DA73 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc89Q9DA73 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc89Q9DA73 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc89Q9DA73 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc89Q9DA73 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms