Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smco2Q9DA21 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smco2Q9DA21 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smco2Q9DA21 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smco2Q9DA21 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smco2Q9DA21 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smco2Q9DA21 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smco2Q9DA21 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smco2Q9DA21 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smco2Q9DA21 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smco2Q9DA21 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smco2Q9DA21 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smco2Q9DA21 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smco2Q9DA21 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smco2Q9DA21 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smco2Q9DA21 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smco2Q9DA21 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smco2Q9DA21 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smco2Q9DA21 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smco2Q9DA21 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smco2Q9DA21 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smco2Q9DA21 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smco2Q9DA21 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smco2Q9DA21 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smco2Q9DA21 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Smco2Q9DA21 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smco2Q9DA21 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smco2Q9DA21 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Smco2Q9DA21 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smco2Q9DA21 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smco2Q9DA21 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smco2Q9DA21 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smco2Q9DA21 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smco2Q9DA21 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smco2Q9DA21 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smco2Q9DA21 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smco2Q9DA21 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smco2Q9DA21 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smco2Q9DA21 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smco2Q9DA21 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smco2Q9DA21 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smco2Q9DA21 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smco2Q9DA21 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smco2Q9DA21 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smco2Q9DA21 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smco2Q9DA21 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smco2Q9DA21 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smco2Q9DA21 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smco2Q9DA21 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smco2Q9DA21 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smco2Q9DA21 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smco2Q9DA21 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smco2Q9DA21 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smco2Q9DA21 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smco2Q9DA21 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smco2Q9DA21 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smco2Q9DA21 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smco2Q9DA21 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smco2Q9DA21 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Smco2Q9DA21 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smco2Q9DA21 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Smco2Q9DA21 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smco2Q9DA21 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smco2Q9DA21 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smco2Q9DA21 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smco2Q9DA21 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smco2Q9DA21 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smco2Q9DA21 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smco2Q9DA21 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smco2Q9DA21 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smco2Q9DA21 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smco2Q9DA21 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smco2Q9DA21 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smco2Q9DA21 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smco2Q9DA21 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smco2Q9DA21 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smco2Q9DA21 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smco2Q9DA21 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smco2Q9DA21 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smco2Q9DA21 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smco2Q9DA21 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smco2Q9DA21 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smco2Q9DA21 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smco2Q9DA21 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smco2Q9DA21 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Smco2Q9DA21 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smco2Q9DA21 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Smco2Q9DA21 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smco2Q9DA21 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smco2Q9DA21 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smco2Q9DA21 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Smco2Q9DA21 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Smco2Q9DA21 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Smco2Q9DA21 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Smco2Q9DA21 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Smco2Q9DA21 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smco2Q9DA21 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smco2Q9DA21 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smco2Q9DA21 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smco2Q9DA21 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms