Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pdzd9Q9D9M4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pdzd9Q9D9M4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pdzd9Q9D9M4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Pdzd9Q9D9M4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pdzd9Q9D9M4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pdzd9Q9D9M4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pdzd9Q9D9M4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pdzd9Q9D9M4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pdzd9Q9D9M4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Pdzd9Q9D9M4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pdzd9Q9D9M4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pdzd9Q9D9M4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pdzd9Q9D9M4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pdzd9Q9D9M4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pdzd9Q9D9M4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pdzd9Q9D9M4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pdzd9Q9D9M4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pdzd9Q9D9M4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pdzd9Q9D9M4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pdzd9Q9D9M4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pdzd9Q9D9M4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pdzd9Q9D9M4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pdzd9Q9D9M4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pdzd9Q9D9M4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pdzd9Q9D9M4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pdzd9Q9D9M4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pdzd9Q9D9M4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pdzd9Q9D9M4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pdzd9Q9D9M4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pdzd9Q9D9M4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pdzd9Q9D9M4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pdzd9Q9D9M4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Pdzd9Q9D9M4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Pdzd9Q9D9M4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pdzd9Q9D9M4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pdzd9Q9D9M4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pdzd9Q9D9M4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pdzd9Q9D9M4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Pdzd9Q9D9M4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pdzd9Q9D9M4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pdzd9Q9D9M4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pdzd9Q9D9M4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pdzd9Q9D9M4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pdzd9Q9D9M4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pdzd9Q9D9M4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pdzd9Q9D9M4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pdzd9Q9D9M4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pdzd9Q9D9M4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pdzd9Q9D9M4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pdzd9Q9D9M4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pdzd9Q9D9M4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Pdzd9Q9D9M4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pdzd9Q9D9M4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pdzd9Q9D9M4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pdzd9Q9D9M4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pdzd9Q9D9M4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pdzd9Q9D9M4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pdzd9Q9D9M4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pdzd9Q9D9M4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pdzd9Q9D9M4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pdzd9Q9D9M4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pdzd9Q9D9M4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pdzd9Q9D9M4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pdzd9Q9D9M4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pdzd9Q9D9M4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pdzd9Q9D9M4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Pdzd9Q9D9M4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pdzd9Q9D9M4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pdzd9Q9D9M4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pdzd9Q9D9M4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pdzd9Q9D9M4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pdzd9Q9D9M4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pdzd9Q9D9M4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pdzd9Q9D9M4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pdzd9Q9D9M4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pdzd9Q9D9M4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pdzd9Q9D9M4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Pdzd9Q9D9M4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Pdzd9Q9D9M4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pdzd9Q9D9M4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Pdzd9Q9D9M4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pdzd9Q9D9M4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Pdzd9Q9D9M4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pdzd9Q9D9M4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pdzd9Q9D9M4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pdzd9Q9D9M4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pdzd9Q9D9M4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pdzd9Q9D9M4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pdzd9Q9D9M4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pdzd9Q9D9M4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pdzd9Q9D9M4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pdzd9Q9D9M4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pdzd9Q9D9M4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pdzd9Q9D9M4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pdzd9Q9D9M4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pdzd9Q9D9M4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pdzd9Q9D9M4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pdzd9Q9D9M4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
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