Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9F7

Speer4b, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4bQ9D9F7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Speer4bQ9D9F7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Speer4bQ9D9F7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Speer4bQ9D9F7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Speer4bQ9D9F7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Speer4bQ9D9F7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Speer4bQ9D9F7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Speer4bQ9D9F7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Speer4bQ9D9F7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Speer4bQ9D9F7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Speer4bQ9D9F7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Speer4bQ9D9F7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Speer4bQ9D9F7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Speer4bQ9D9F7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Speer4bQ9D9F7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Speer4bQ9D9F7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Speer4bQ9D9F7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Speer4bQ9D9F7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Speer4bQ9D9F7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Speer4bQ9D9F7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Speer4bQ9D9F7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Speer4bQ9D9F7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Speer4bQ9D9F7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Speer4bQ9D9F7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Speer4bQ9D9F7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Speer4bQ9D9F7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Speer4bQ9D9F7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Speer4bQ9D9F7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Speer4bQ9D9F7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Speer4bQ9D9F7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Speer4bQ9D9F7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Speer4bQ9D9F7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Speer4bQ9D9F7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Speer4bQ9D9F7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Speer4bQ9D9F7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Speer4bQ9D9F7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Speer4bQ9D9F7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Speer4bQ9D9F7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Speer4bQ9D9F7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Speer4bQ9D9F7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Speer4bQ9D9F7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Speer4bQ9D9F7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Speer4bQ9D9F7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Speer4bQ9D9F7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Speer4bQ9D9F7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Speer4bQ9D9F7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Speer4bQ9D9F7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Speer4bQ9D9F7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Speer4bQ9D9F7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Speer4bQ9D9F7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Speer4bQ9D9F7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Speer4bQ9D9F7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Speer4bQ9D9F7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Speer4bQ9D9F7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Speer4bQ9D9F7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Speer4bQ9D9F7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Speer4bQ9D9F7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Speer4bQ9D9F7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Speer4bQ9D9F7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Speer4bQ9D9F7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Speer4bQ9D9F7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Speer4bQ9D9F7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Speer4bQ9D9F7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Speer4bQ9D9F7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Speer4bQ9D9F7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Speer4bQ9D9F7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Speer4bQ9D9F7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Speer4bQ9D9F7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Speer4bQ9D9F7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Speer4bQ9D9F7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Speer4bQ9D9F7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Speer4bQ9D9F7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Speer4bQ9D9F7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Speer4bQ9D9F7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Speer4bQ9D9F7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Speer4bQ9D9F7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Speer4bQ9D9F7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Speer4bQ9D9F7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Speer4bQ9D9F7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Speer4bQ9D9F7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Speer4bQ9D9F7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Speer4bQ9D9F7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Speer4bQ9D9F7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Speer4bQ9D9F7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Speer4bQ9D9F7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Speer4bQ9D9F7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Speer4bQ9D9F7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Speer4bQ9D9F7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Speer4bQ9D9F7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Speer4bQ9D9F7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Speer4bQ9D9F7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Speer4bQ9D9F7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Speer4bQ9D9F7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Speer4bQ9D9F7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Speer4bQ9D9F7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Speer4bQ9D9F7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Speer4bQ9D9F7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Speer4bQ9D9F7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Speer4bQ9D9F7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Speer4bQ9D9F7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms