Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9C0

1700109H08Rik, RIKEN cDNA 1700109H08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700109H08RikQ9D9C0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
1700109H08RikQ9D9C0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
1700109H08RikQ9D9C0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
1700109H08RikQ9D9C0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
1700109H08RikQ9D9C0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
1700109H08RikQ9D9C0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
1700109H08RikQ9D9C0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
1700109H08RikQ9D9C0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
1700109H08RikQ9D9C0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
1700109H08RikQ9D9C0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
1700109H08RikQ9D9C0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700109H08RikQ9D9C0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700109H08RikQ9D9C0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700109H08RikQ9D9C0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700109H08RikQ9D9C0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700109H08RikQ9D9C0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700109H08RikQ9D9C0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700109H08RikQ9D9C0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
1700109H08RikQ9D9C0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
1700109H08RikQ9D9C0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
1700109H08RikQ9D9C0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
1700109H08RikQ9D9C0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
1700109H08RikQ9D9C0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
1700109H08RikQ9D9C0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
1700109H08RikQ9D9C0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
1700109H08RikQ9D9C0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
1700109H08RikQ9D9C0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
1700109H08RikQ9D9C0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
1700109H08RikQ9D9C0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
1700109H08RikQ9D9C0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
1700109H08RikQ9D9C0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
1700109H08RikQ9D9C0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
1700109H08RikQ9D9C0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1700109H08RikQ9D9C0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1700109H08RikQ9D9C0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1700109H08RikQ9D9C0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1700109H08RikQ9D9C0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1700109H08RikQ9D9C0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
1700109H08RikQ9D9C0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
1700109H08RikQ9D9C0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1700109H08RikQ9D9C0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1700109H08RikQ9D9C0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
1700109H08RikQ9D9C0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
1700109H08RikQ9D9C0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
1700109H08RikQ9D9C0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
1700109H08RikQ9D9C0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
1700109H08RikQ9D9C0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
1700109H08RikQ9D9C0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
1700109H08RikQ9D9C0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700109H08RikQ9D9C0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700109H08RikQ9D9C0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700109H08RikQ9D9C0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700109H08RikQ9D9C0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700109H08RikQ9D9C0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700109H08RikQ9D9C0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700109H08RikQ9D9C0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700109H08RikQ9D9C0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
1700109H08RikQ9D9C0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
1700109H08RikQ9D9C0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
1700109H08RikQ9D9C0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
1700109H08RikQ9D9C0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
1700109H08RikQ9D9C0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
1700109H08RikQ9D9C0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700109H08RikQ9D9C0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700109H08RikQ9D9C0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700109H08RikQ9D9C0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700109H08RikQ9D9C0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700109H08RikQ9D9C0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700109H08RikQ9D9C0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700109H08RikQ9D9C0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700109H08RikQ9D9C0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700109H08RikQ9D9C0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700109H08RikQ9D9C0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700109H08RikQ9D9C0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700109H08RikQ9D9C0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700109H08RikQ9D9C0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700109H08RikQ9D9C0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700109H08RikQ9D9C0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700109H08RikQ9D9C0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700109H08RikQ9D9C0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
1700109H08RikQ9D9C0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700109H08RikQ9D9C0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700109H08RikQ9D9C0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700109H08RikQ9D9C0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700109H08RikQ9D9C0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700109H08RikQ9D9C0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700109H08RikQ9D9C0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700109H08RikQ9D9C0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700109H08RikQ9D9C0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700109H08RikQ9D9C0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700109H08RikQ9D9C0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700109H08RikQ9D9C0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700109H08RikQ9D9C0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700109H08RikQ9D9C0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700109H08RikQ9D9C0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700109H08RikQ9D9C0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700109H08RikQ9D9C0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700109H08RikQ9D9C0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700109H08RikQ9D9C0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700109H08RikQ9D9C0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms