Protein–RNA interactions for Protein: Q9D968

Hcfc2, Host cell factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc2Q9D968 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Hcfc2Q9D968 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hcfc2Q9D968 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hcfc2Q9D968 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hcfc2Q9D968 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hcfc2Q9D968 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hcfc2Q9D968 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcfc2Q9D968 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms