Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnot8Q9D8X5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnot8Q9D8X5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnot8Q9D8X5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnot8Q9D8X5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnot8Q9D8X5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnot8Q9D8X5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnot8Q9D8X5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnot8Q9D8X5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnot8Q9D8X5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnot8Q9D8X5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnot8Q9D8X5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnot8Q9D8X5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnot8Q9D8X5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnot8Q9D8X5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnot8Q9D8X5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnot8Q9D8X5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnot8Q9D8X5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnot8Q9D8X5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnot8Q9D8X5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnot8Q9D8X5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnot8Q9D8X5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnot8Q9D8X5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cnot8Q9D8X5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnot8Q9D8X5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnot8Q9D8X5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnot8Q9D8X5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnot8Q9D8X5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnot8Q9D8X5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnot8Q9D8X5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnot8Q9D8X5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnot8Q9D8X5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnot8Q9D8X5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnot8Q9D8X5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnot8Q9D8X5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnot8Q9D8X5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnot8Q9D8X5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnot8Q9D8X5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnot8Q9D8X5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnot8Q9D8X5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnot8Q9D8X5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnot8Q9D8X5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnot8Q9D8X5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnot8Q9D8X5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnot8Q9D8X5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnot8Q9D8X5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnot8Q9D8X5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnot8Q9D8X5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnot8Q9D8X5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnot8Q9D8X5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnot8Q9D8X5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnot8Q9D8X5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnot8Q9D8X5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnot8Q9D8X5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnot8Q9D8X5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnot8Q9D8X5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnot8Q9D8X5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnot8Q9D8X5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnot8Q9D8X5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnot8Q9D8X5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnot8Q9D8X5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnot8Q9D8X5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnot8Q9D8X5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnot8Q9D8X5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnot8Q9D8X5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnot8Q9D8X5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnot8Q9D8X5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnot8Q9D8X5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnot8Q9D8X5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnot8Q9D8X5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnot8Q9D8X5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnot8Q9D8X5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnot8Q9D8X5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnot8Q9D8X5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnot8Q9D8X5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnot8Q9D8X5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnot8Q9D8X5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnot8Q9D8X5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnot8Q9D8X5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnot8Q9D8X5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnot8Q9D8X5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnot8Q9D8X5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnot8Q9D8X5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnot8Q9D8X5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnot8Q9D8X5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnot8Q9D8X5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnot8Q9D8X5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnot8Q9D8X5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnot8Q9D8X5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnot8Q9D8X5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnot8Q9D8X5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnot8Q9D8X5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cnot8Q9D8X5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cnot8Q9D8X5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cnot8Q9D8X5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cnot8Q9D8X5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnot8Q9D8X5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnot8Q9D8X5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnot8Q9D8X5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnot8Q9D8X5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms