Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tvp23bQ9D8T4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tvp23bQ9D8T4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tvp23bQ9D8T4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Tvp23bQ9D8T4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tvp23bQ9D8T4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tvp23bQ9D8T4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tvp23bQ9D8T4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tvp23bQ9D8T4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tvp23bQ9D8T4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tvp23bQ9D8T4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tvp23bQ9D8T4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tvp23bQ9D8T4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tvp23bQ9D8T4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Tvp23bQ9D8T4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tvp23bQ9D8T4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Tvp23bQ9D8T4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tvp23bQ9D8T4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tvp23bQ9D8T4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tvp23bQ9D8T4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tvp23bQ9D8T4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tvp23bQ9D8T4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tvp23bQ9D8T4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tvp23bQ9D8T4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tvp23bQ9D8T4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tvp23bQ9D8T4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tvp23bQ9D8T4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tvp23bQ9D8T4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tvp23bQ9D8T4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tvp23bQ9D8T4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tvp23bQ9D8T4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tvp23bQ9D8T4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tvp23bQ9D8T4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tvp23bQ9D8T4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tvp23bQ9D8T4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tvp23bQ9D8T4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tvp23bQ9D8T4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tvp23bQ9D8T4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tvp23bQ9D8T4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms