Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P4

Mrpl17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl17Q9D8P4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrpl17Q9D8P4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrpl17Q9D8P4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrpl17Q9D8P4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrpl17Q9D8P4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrpl17Q9D8P4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrpl17Q9D8P4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrpl17Q9D8P4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrpl17Q9D8P4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrpl17Q9D8P4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrpl17Q9D8P4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrpl17Q9D8P4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrpl17Q9D8P4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrpl17Q9D8P4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrpl17Q9D8P4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrpl17Q9D8P4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrpl17Q9D8P4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl17Q9D8P4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl17Q9D8P4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl17Q9D8P4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl17Q9D8P4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl17Q9D8P4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl17Q9D8P4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl17Q9D8P4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl17Q9D8P4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl17Q9D8P4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mrpl17Q9D8P4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mrpl17Q9D8P4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mrpl17Q9D8P4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mrpl17Q9D8P4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mrpl17Q9D8P4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mrpl17Q9D8P4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mrpl17Q9D8P4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mrpl17Q9D8P4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mrpl17Q9D8P4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mrpl17Q9D8P4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mrpl17Q9D8P4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mrpl17Q9D8P4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl17Q9D8P4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl17Q9D8P4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl17Q9D8P4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl17Q9D8P4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl17Q9D8P4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl17Q9D8P4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl17Q9D8P4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl17Q9D8P4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl17Q9D8P4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl17Q9D8P4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl17Q9D8P4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl17Q9D8P4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl17Q9D8P4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl17Q9D8P4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mrpl17Q9D8P4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mrpl17Q9D8P4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mrpl17Q9D8P4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mrpl17Q9D8P4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mrpl17Q9D8P4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mrpl17Q9D8P4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mrpl17Q9D8P4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrpl17Q9D8P4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrpl17Q9D8P4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrpl17Q9D8P4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrpl17Q9D8P4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl17Q9D8P4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl17Q9D8P4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl17Q9D8P4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl17Q9D8P4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl17Q9D8P4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl17Q9D8P4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl17Q9D8P4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl17Q9D8P4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl17Q9D8P4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl17Q9D8P4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl17Q9D8P4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl17Q9D8P4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl17Q9D8P4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl17Q9D8P4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl17Q9D8P4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl17Q9D8P4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl17Q9D8P4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl17Q9D8P4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl17Q9D8P4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl17Q9D8P4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl17Q9D8P4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl17Q9D8P4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl17Q9D8P4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl17Q9D8P4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl17Q9D8P4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl17Q9D8P4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl17Q9D8P4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl17Q9D8P4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl17Q9D8P4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl17Q9D8P4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mrpl17Q9D8P4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mrpl17Q9D8P4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mrpl17Q9D8P4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Mrpl17Q9D8P4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mrpl17Q9D8P4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl17Q9D8P4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl17Q9D8P4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172.9 ms