Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Slc52a2Q9D8F3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Slc52a2Q9D8F3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Slc52a2Q9D8F3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Slc52a2Q9D8F3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Slc52a2Q9D8F3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Slc52a2Q9D8F3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Slc52a2Q9D8F3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Slc52a2Q9D8F3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Slc52a2Q9D8F3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Slc52a2Q9D8F3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Slc52a2Q9D8F3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Slc52a2Q9D8F3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Slc52a2Q9D8F3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Slc52a2Q9D8F3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Slc52a2Q9D8F3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Slc52a2Q9D8F3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Slc52a2Q9D8F3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Slc52a2Q9D8F3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Slc52a2Q9D8F3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Slc52a2Q9D8F3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Slc52a2Q9D8F3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Slc52a2Q9D8F3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Slc52a2Q9D8F3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Slc52a2Q9D8F3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Slc52a2Q9D8F3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Slc52a2Q9D8F3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Slc52a2Q9D8F3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Slc52a2Q9D8F3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Slc52a2Q9D8F3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Slc52a2Q9D8F3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Slc52a2Q9D8F3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Slc52a2Q9D8F3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Slc52a2Q9D8F3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Slc52a2Q9D8F3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Slc52a2Q9D8F3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Slc52a2Q9D8F3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Slc52a2Q9D8F3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Slc52a2Q9D8F3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Slc52a2Q9D8F3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Slc52a2Q9D8F3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Slc52a2Q9D8F3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Slc52a2Q9D8F3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Slc52a2Q9D8F3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Slc52a2Q9D8F3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Slc52a2Q9D8F3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Slc52a2Q9D8F3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Slc52a2Q9D8F3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Slc52a2Q9D8F3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Slc52a2Q9D8F3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Slc52a2Q9D8F3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Slc52a2Q9D8F3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Slc52a2Q9D8F3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Slc52a2Q9D8F3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Slc52a2Q9D8F3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Slc52a2Q9D8F3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Slc52a2Q9D8F3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Slc52a2Q9D8F3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Slc52a2Q9D8F3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Slc52a2Q9D8F3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Slc52a2Q9D8F3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Slc52a2Q9D8F3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Slc52a2Q9D8F3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Slc52a2Q9D8F3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Slc52a2Q9D8F3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Slc52a2Q9D8F3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Slc52a2Q9D8F3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Slc52a2Q9D8F3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Slc52a2Q9D8F3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Slc52a2Q9D8F3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Slc52a2Q9D8F3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Slc52a2Q9D8F3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Slc52a2Q9D8F3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Slc52a2Q9D8F3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Slc52a2Q9D8F3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Slc52a2Q9D8F3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Slc52a2Q9D8F3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Slc52a2Q9D8F3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Slc52a2Q9D8F3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Slc52a2Q9D8F3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Slc52a2Q9D8F3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Slc52a2Q9D8F3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Slc52a2Q9D8F3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Slc52a2Q9D8F3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Slc52a2Q9D8F3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Slc52a2Q9D8F3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Slc52a2Q9D8F3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Slc52a2Q9D8F3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Slc52a2Q9D8F3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Slc52a2Q9D8F3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Slc52a2Q9D8F3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Slc52a2Q9D8F3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Slc52a2Q9D8F3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Slc52a2Q9D8F3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Slc52a2Q9D8F3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Slc52a2Q9D8F3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Slc52a2Q9D8F3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Slc52a2Q9D8F3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Slc52a2Q9D8F3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Slc52a2Q9D8F3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms