Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
U2af1Q9D883 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
U2af1Q9D883 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
U2af1Q9D883 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
U2af1Q9D883 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
U2af1Q9D883 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
U2af1Q9D883 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
U2af1Q9D883 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
U2af1Q9D883 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
U2af1Q9D883 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
U2af1Q9D883 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
U2af1Q9D883 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
U2af1Q9D883 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
U2af1Q9D883 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
U2af1Q9D883 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
U2af1Q9D883 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
U2af1Q9D883 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
U2af1Q9D883 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
U2af1Q9D883 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
U2af1Q9D883 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
U2af1Q9D883 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
U2af1Q9D883 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
U2af1Q9D883 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
U2af1Q9D883 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
U2af1Q9D883 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
U2af1Q9D883 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
U2af1Q9D883 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
U2af1Q9D883 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
U2af1Q9D883 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
U2af1Q9D883 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
U2af1Q9D883 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
U2af1Q9D883 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
U2af1Q9D883 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
U2af1Q9D883 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
U2af1Q9D883 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
U2af1Q9D883 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
U2af1Q9D883 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
U2af1Q9D883 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
U2af1Q9D883 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
U2af1Q9D883 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
U2af1Q9D883 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
U2af1Q9D883 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
U2af1Q9D883 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
U2af1Q9D883 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
U2af1Q9D883 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
U2af1Q9D883 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
U2af1Q9D883 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
U2af1Q9D883 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
U2af1Q9D883 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
U2af1Q9D883 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
U2af1Q9D883 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
U2af1Q9D883 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
U2af1Q9D883 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
U2af1Q9D883 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
U2af1Q9D883 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
U2af1Q9D883 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
U2af1Q9D883 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
U2af1Q9D883 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
U2af1Q9D883 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
U2af1Q9D883 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
U2af1Q9D883 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
U2af1Q9D883 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
U2af1Q9D883 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
U2af1Q9D883 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
U2af1Q9D883 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
U2af1Q9D883 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
U2af1Q9D883 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
U2af1Q9D883 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
U2af1Q9D883 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
U2af1Q9D883 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
U2af1Q9D883 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
U2af1Q9D883 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
U2af1Q9D883 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
U2af1Q9D883 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
U2af1Q9D883 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
U2af1Q9D883 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
U2af1Q9D883 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
U2af1Q9D883 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
U2af1Q9D883 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
U2af1Q9D883 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
U2af1Q9D883 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
U2af1Q9D883 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
U2af1Q9D883 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
U2af1Q9D883 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
U2af1Q9D883 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
U2af1Q9D883 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
U2af1Q9D883 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
U2af1Q9D883 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
U2af1Q9D883 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
U2af1Q9D883 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
U2af1Q9D883 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
U2af1Q9D883 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
U2af1Q9D883 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
U2af1Q9D883 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
U2af1Q9D883 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
U2af1Q9D883 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
U2af1Q9D883 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
U2af1Q9D883 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
U2af1Q9D883 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
U2af1Q9D883 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms