Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.6 ms