Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capns2Q9D7J7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Capns2Q9D7J7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capns2Q9D7J7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capns2Q9D7J7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capns2Q9D7J7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capns2Q9D7J7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capns2Q9D7J7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capns2Q9D7J7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capns2Q9D7J7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capns2Q9D7J7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capns2Q9D7J7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capns2Q9D7J7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capns2Q9D7J7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capns2Q9D7J7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capns2Q9D7J7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Capns2Q9D7J7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Capns2Q9D7J7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capns2Q9D7J7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capns2Q9D7J7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Capns2Q9D7J7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capns2Q9D7J7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capns2Q9D7J7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capns2Q9D7J7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capns2Q9D7J7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capns2Q9D7J7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Capns2Q9D7J7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Capns2Q9D7J7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Capns2Q9D7J7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Capns2Q9D7J7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Capns2Q9D7J7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Capns2Q9D7J7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capns2Q9D7J7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capns2Q9D7J7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capns2Q9D7J7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capns2Q9D7J7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capns2Q9D7J7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capns2Q9D7J7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capns2Q9D7J7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Capns2Q9D7J7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capns2Q9D7J7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capns2Q9D7J7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capns2Q9D7J7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capns2Q9D7J7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capns2Q9D7J7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Capns2Q9D7J7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capns2Q9D7J7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capns2Q9D7J7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capns2Q9D7J7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Capns2Q9D7J7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Capns2Q9D7J7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Capns2Q9D7J7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Capns2Q9D7J7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Capns2Q9D7J7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Capns2Q9D7J7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Capns2Q9D7J7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Capns2Q9D7J7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Capns2Q9D7J7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capns2Q9D7J7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capns2Q9D7J7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capns2Q9D7J7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capns2Q9D7J7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Capns2Q9D7J7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capns2Q9D7J7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capns2Q9D7J7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capns2Q9D7J7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Capns2Q9D7J7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Capns2Q9D7J7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Capns2Q9D7J7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Capns2Q9D7J7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Capns2Q9D7J7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Capns2Q9D7J7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Capns2Q9D7J7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Capns2Q9D7J7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Capns2Q9D7J7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Capns2Q9D7J7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Capns2Q9D7J7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Capns2Q9D7J7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Capns2Q9D7J7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Capns2Q9D7J7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Capns2Q9D7J7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Capns2Q9D7J7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Capns2Q9D7J7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Capns2Q9D7J7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Capns2Q9D7J7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Capns2Q9D7J7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Capns2Q9D7J7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Capns2Q9D7J7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Capns2Q9D7J7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Capns2Q9D7J7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Capns2Q9D7J7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Capns2Q9D7J7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Capns2Q9D7J7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Capns2Q9D7J7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Capns2Q9D7J7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Capns2Q9D7J7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Capns2Q9D7J7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Capns2Q9D7J7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Capns2Q9D7J7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Capns2Q9D7J7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms