Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7I9

Tgm5, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 5, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm5Q9D7I9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tgm5Q9D7I9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tgm5Q9D7I9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tgm5Q9D7I9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tgm5Q9D7I9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tgm5Q9D7I9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Tgm5Q9D7I9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tgm5Q9D7I9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tgm5Q9D7I9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tgm5Q9D7I9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tgm5Q9D7I9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tgm5Q9D7I9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tgm5Q9D7I9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tgm5Q9D7I9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tgm5Q9D7I9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Tgm5Q9D7I9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tgm5Q9D7I9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tgm5Q9D7I9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tgm5Q9D7I9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tgm5Q9D7I9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tgm5Q9D7I9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Tgm5Q9D7I9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tgm5Q9D7I9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tgm5Q9D7I9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tgm5Q9D7I9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tgm5Q9D7I9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tgm5Q9D7I9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tgm5Q9D7I9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tgm5Q9D7I9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Tgm5Q9D7I9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tgm5Q9D7I9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tgm5Q9D7I9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tgm5Q9D7I9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tgm5Q9D7I9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tgm5Q9D7I9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tgm5Q9D7I9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tgm5Q9D7I9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tgm5Q9D7I9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tgm5Q9D7I9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tgm5Q9D7I9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tgm5Q9D7I9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tgm5Q9D7I9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tgm5Q9D7I9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tgm5Q9D7I9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Tgm5Q9D7I9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tgm5Q9D7I9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Tgm5Q9D7I9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tgm5Q9D7I9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tgm5Q9D7I9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tgm5Q9D7I9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Tgm5Q9D7I9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tgm5Q9D7I9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tgm5Q9D7I9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tgm5Q9D7I9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tgm5Q9D7I9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tgm5Q9D7I9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Tgm5Q9D7I9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tgm5Q9D7I9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tgm5Q9D7I9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tgm5Q9D7I9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tgm5Q9D7I9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tgm5Q9D7I9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tgm5Q9D7I9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tgm5Q9D7I9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tgm5Q9D7I9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tgm5Q9D7I9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tgm5Q9D7I9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tgm5Q9D7I9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tgm5Q9D7I9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tgm5Q9D7I9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tgm5Q9D7I9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tgm5Q9D7I9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tgm5Q9D7I9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tgm5Q9D7I9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Tgm5Q9D7I9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tgm5Q9D7I9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tgm5Q9D7I9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tgm5Q9D7I9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tgm5Q9D7I9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tgm5Q9D7I9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tgm5Q9D7I9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tgm5Q9D7I9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Tgm5Q9D7I9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tgm5Q9D7I9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tgm5Q9D7I9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tgm5Q9D7I9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tgm5Q9D7I9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tgm5Q9D7I9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tgm5Q9D7I9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tgm5Q9D7I9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tgm5Q9D7I9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Tgm5Q9D7I9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tgm5Q9D7I9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tgm5Q9D7I9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tgm5Q9D7I9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tgm5Q9D7I9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tgm5Q9D7I9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tgm5Q9D7I9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tgm5Q9D7I9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tgm5Q9D7I9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms