Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Chmp4cQ9D7F7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chmp4cQ9D7F7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chmp4cQ9D7F7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chmp4cQ9D7F7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Chmp4cQ9D7F7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chmp4cQ9D7F7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chmp4cQ9D7F7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chmp4cQ9D7F7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chmp4cQ9D7F7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Chmp4cQ9D7F7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Chmp4cQ9D7F7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chmp4cQ9D7F7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chmp4cQ9D7F7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chmp4cQ9D7F7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chmp4cQ9D7F7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chmp4cQ9D7F7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chmp4cQ9D7F7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chmp4cQ9D7F7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chmp4cQ9D7F7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chmp4cQ9D7F7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chmp4cQ9D7F7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chmp4cQ9D7F7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chmp4cQ9D7F7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chmp4cQ9D7F7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chmp4cQ9D7F7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Chmp4cQ9D7F7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chmp4cQ9D7F7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chmp4cQ9D7F7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chmp4cQ9D7F7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chmp4cQ9D7F7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chmp4cQ9D7F7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chmp4cQ9D7F7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chmp4cQ9D7F7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chmp4cQ9D7F7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chmp4cQ9D7F7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chmp4cQ9D7F7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chmp4cQ9D7F7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chmp4cQ9D7F7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chmp4cQ9D7F7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chmp4cQ9D7F7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chmp4cQ9D7F7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chmp4cQ9D7F7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chmp4cQ9D7F7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chmp4cQ9D7F7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chmp4cQ9D7F7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chmp4cQ9D7F7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chmp4cQ9D7F7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chmp4cQ9D7F7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chmp4cQ9D7F7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chmp4cQ9D7F7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chmp4cQ9D7F7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chmp4cQ9D7F7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chmp4cQ9D7F7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chmp4cQ9D7F7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chmp4cQ9D7F7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chmp4cQ9D7F7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Chmp4cQ9D7F7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chmp4cQ9D7F7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chmp4cQ9D7F7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chmp4cQ9D7F7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Chmp4cQ9D7F7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chmp4cQ9D7F7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chmp4cQ9D7F7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chmp4cQ9D7F7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chmp4cQ9D7F7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chmp4cQ9D7F7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chmp4cQ9D7F7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chmp4cQ9D7F7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chmp4cQ9D7F7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chmp4cQ9D7F7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chmp4cQ9D7F7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chmp4cQ9D7F7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chmp4cQ9D7F7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chmp4cQ9D7F7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chmp4cQ9D7F7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chmp4cQ9D7F7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chmp4cQ9D7F7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chmp4cQ9D7F7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chmp4cQ9D7F7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chmp4cQ9D7F7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chmp4cQ9D7F7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chmp4cQ9D7F7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chmp4cQ9D7F7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chmp4cQ9D7F7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chmp4cQ9D7F7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chmp4cQ9D7F7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chmp4cQ9D7F7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chmp4cQ9D7F7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chmp4cQ9D7F7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chmp4cQ9D7F7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chmp4cQ9D7F7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chmp4cQ9D7F7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chmp4cQ9D7F7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chmp4cQ9D7F7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chmp4cQ9D7F7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chmp4cQ9D7F7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chmp4cQ9D7F7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Chmp4cQ9D7F7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Chmp4cQ9D7F7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms