Protein–RNA interactions for Protein: Q9D706

Rpap3, RNA polymerase II-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap3Q9D706 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpap3Q9D706 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpap3Q9D706 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpap3Q9D706 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpap3Q9D706 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpap3Q9D706 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpap3Q9D706 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpap3Q9D706 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpap3Q9D706 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpap3Q9D706 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpap3Q9D706 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpap3Q9D706 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpap3Q9D706 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpap3Q9D706 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpap3Q9D706 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpap3Q9D706 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpap3Q9D706 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpap3Q9D706 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpap3Q9D706 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpap3Q9D706 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpap3Q9D706 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpap3Q9D706 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpap3Q9D706 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpap3Q9D706 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpap3Q9D706 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpap3Q9D706 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpap3Q9D706 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpap3Q9D706 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpap3Q9D706 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpap3Q9D706 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpap3Q9D706 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpap3Q9D706 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Rpap3Q9D706 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rpap3Q9D706 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rpap3Q9D706 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rpap3Q9D706 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpap3Q9D706 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpap3Q9D706 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpap3Q9D706 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpap3Q9D706 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpap3Q9D706 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpap3Q9D706 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpap3Q9D706 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpap3Q9D706 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpap3Q9D706 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpap3Q9D706 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpap3Q9D706 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpap3Q9D706 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpap3Q9D706 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpap3Q9D706 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpap3Q9D706 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpap3Q9D706 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpap3Q9D706 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpap3Q9D706 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpap3Q9D706 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpap3Q9D706 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpap3Q9D706 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpap3Q9D706 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpap3Q9D706 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpap3Q9D706 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpap3Q9D706 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpap3Q9D706 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rpap3Q9D706 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rpap3Q9D706 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rpap3Q9D706 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rpap3Q9D706 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rpap3Q9D706 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rpap3Q9D706 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rpap3Q9D706 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rpap3Q9D706 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rpap3Q9D706 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rpap3Q9D706 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rpap3Q9D706 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpap3Q9D706 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpap3Q9D706 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpap3Q9D706 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpap3Q9D706 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpap3Q9D706 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpap3Q9D706 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpap3Q9D706 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpap3Q9D706 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpap3Q9D706 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpap3Q9D706 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpap3Q9D706 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpap3Q9D706 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpap3Q9D706 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpap3Q9D706 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpap3Q9D706 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpap3Q9D706 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpap3Q9D706 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpap3Q9D706 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpap3Q9D706 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpap3Q9D706 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpap3Q9D706 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpap3Q9D706 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpap3Q9D706 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpap3Q9D706 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpap3Q9D706 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpap3Q9D706 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpap3Q9D706 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms