Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Borcs6Q9D6W8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Borcs6Q9D6W8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Borcs6Q9D6W8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Borcs6Q9D6W8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Borcs6Q9D6W8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Borcs6Q9D6W8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Borcs6Q9D6W8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Borcs6Q9D6W8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Borcs6Q9D6W8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Borcs6Q9D6W8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Borcs6Q9D6W8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Borcs6Q9D6W8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Borcs6Q9D6W8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Borcs6Q9D6W8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Borcs6Q9D6W8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Borcs6Q9D6W8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Borcs6Q9D6W8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Borcs6Q9D6W8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Borcs6Q9D6W8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Borcs6Q9D6W8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Borcs6Q9D6W8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Borcs6Q9D6W8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Borcs6Q9D6W8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Borcs6Q9D6W8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Borcs6Q9D6W8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Borcs6Q9D6W8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Borcs6Q9D6W8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Borcs6Q9D6W8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Borcs6Q9D6W8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Borcs6Q9D6W8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Borcs6Q9D6W8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Borcs6Q9D6W8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Borcs6Q9D6W8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Borcs6Q9D6W8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Borcs6Q9D6W8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Borcs6Q9D6W8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Borcs6Q9D6W8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Borcs6Q9D6W8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Borcs6Q9D6W8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Borcs6Q9D6W8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Borcs6Q9D6W8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Borcs6Q9D6W8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Borcs6Q9D6W8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Borcs6Q9D6W8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Borcs6Q9D6W8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Borcs6Q9D6W8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Borcs6Q9D6W8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Borcs6Q9D6W8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Borcs6Q9D6W8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Borcs6Q9D6W8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Borcs6Q9D6W8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Borcs6Q9D6W8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Borcs6Q9D6W8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Borcs6Q9D6W8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Borcs6Q9D6W8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Borcs6Q9D6W8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Borcs6Q9D6W8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Borcs6Q9D6W8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Borcs6Q9D6W8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Borcs6Q9D6W8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Borcs6Q9D6W8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Borcs6Q9D6W8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Borcs6Q9D6W8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Borcs6Q9D6W8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Borcs6Q9D6W8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Borcs6Q9D6W8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Borcs6Q9D6W8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Borcs6Q9D6W8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Borcs6Q9D6W8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Borcs6Q9D6W8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Borcs6Q9D6W8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Borcs6Q9D6W8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Borcs6Q9D6W8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Borcs6Q9D6W8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Borcs6Q9D6W8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Borcs6Q9D6W8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Borcs6Q9D6W8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Borcs6Q9D6W8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Borcs6Q9D6W8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Borcs6Q9D6W8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Borcs6Q9D6W8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Borcs6Q9D6W8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Borcs6Q9D6W8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Borcs6Q9D6W8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Borcs6Q9D6W8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Borcs6Q9D6W8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Borcs6Q9D6W8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Borcs6Q9D6W8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Borcs6Q9D6W8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Borcs6Q9D6W8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Borcs6Q9D6W8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Borcs6Q9D6W8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Borcs6Q9D6W8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Borcs6Q9D6W8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Borcs6Q9D6W8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Borcs6Q9D6W8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Borcs6Q9D6W8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Borcs6Q9D6W8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Borcs6Q9D6W8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms