Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptp4a3Q9D658 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptp4a3Q9D658 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptp4a3Q9D658 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptp4a3Q9D658 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptp4a3Q9D658 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptp4a3Q9D658 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptp4a3Q9D658 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptp4a3Q9D658 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptp4a3Q9D658 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptp4a3Q9D658 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptp4a3Q9D658 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptp4a3Q9D658 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptp4a3Q9D658 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptp4a3Q9D658 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptp4a3Q9D658 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptp4a3Q9D658 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptp4a3Q9D658 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptp4a3Q9D658 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptp4a3Q9D658 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptp4a3Q9D658 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptp4a3Q9D658 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptp4a3Q9D658 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptp4a3Q9D658 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptp4a3Q9D658 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptp4a3Q9D658 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ptp4a3Q9D658 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ptp4a3Q9D658 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptp4a3Q9D658 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptp4a3Q9D658 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptp4a3Q9D658 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptp4a3Q9D658 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptp4a3Q9D658 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptp4a3Q9D658 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ptp4a3Q9D658 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ptp4a3Q9D658 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ptp4a3Q9D658 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ptp4a3Q9D658 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ptp4a3Q9D658 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ptp4a3Q9D658 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ptp4a3Q9D658 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ptp4a3Q9D658 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ptp4a3Q9D658 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ptp4a3Q9D658 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms