Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc81Q9D5W4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc81Q9D5W4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc81Q9D5W4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc81Q9D5W4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc81Q9D5W4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc81Q9D5W4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc81Q9D5W4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc81Q9D5W4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc81Q9D5W4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc81Q9D5W4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc81Q9D5W4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc81Q9D5W4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc81Q9D5W4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc81Q9D5W4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc81Q9D5W4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc81Q9D5W4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc81Q9D5W4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc81Q9D5W4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc81Q9D5W4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc81Q9D5W4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc81Q9D5W4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc81Q9D5W4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc81Q9D5W4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc81Q9D5W4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc81Q9D5W4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc81Q9D5W4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc81Q9D5W4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc81Q9D5W4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc81Q9D5W4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc81Q9D5W4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc81Q9D5W4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc81Q9D5W4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc81Q9D5W4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc81Q9D5W4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc81Q9D5W4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc81Q9D5W4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc81Q9D5W4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc81Q9D5W4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc81Q9D5W4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc81Q9D5W4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc81Q9D5W4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc81Q9D5W4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc81Q9D5W4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc81Q9D5W4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc81Q9D5W4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc81Q9D5W4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc81Q9D5W4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc81Q9D5W4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc81Q9D5W4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc81Q9D5W4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc81Q9D5W4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc81Q9D5W4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc81Q9D5W4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc81Q9D5W4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc81Q9D5W4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc81Q9D5W4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc81Q9D5W4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc81Q9D5W4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc81Q9D5W4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc81Q9D5W4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc81Q9D5W4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc81Q9D5W4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc81Q9D5W4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc81Q9D5W4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc81Q9D5W4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc81Q9D5W4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc81Q9D5W4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc81Q9D5W4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc81Q9D5W4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc81Q9D5W4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc81Q9D5W4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc81Q9D5W4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc81Q9D5W4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc81Q9D5W4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc81Q9D5W4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc81Q9D5W4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc81Q9D5W4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc81Q9D5W4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc81Q9D5W4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc81Q9D5W4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc81Q9D5W4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc81Q9D5W4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc81Q9D5W4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc81Q9D5W4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc81Q9D5W4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc81Q9D5W4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc81Q9D5W4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc81Q9D5W4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc81Q9D5W4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc81Q9D5W4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc81Q9D5W4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc81Q9D5W4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc81Q9D5W4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc81Q9D5W4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc81Q9D5W4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc81Q9D5W4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc81Q9D5W4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc81Q9D5W4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc81Q9D5W4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms