Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5T0

Atad1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad1Q9D5T0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atad1Q9D5T0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atad1Q9D5T0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atad1Q9D5T0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atad1Q9D5T0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atad1Q9D5T0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atad1Q9D5T0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atad1Q9D5T0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atad1Q9D5T0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atad1Q9D5T0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atad1Q9D5T0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atad1Q9D5T0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atad1Q9D5T0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atad1Q9D5T0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atad1Q9D5T0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atad1Q9D5T0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atad1Q9D5T0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atad1Q9D5T0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atad1Q9D5T0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atad1Q9D5T0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atad1Q9D5T0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atad1Q9D5T0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atad1Q9D5T0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atad1Q9D5T0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atad1Q9D5T0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atad1Q9D5T0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atad1Q9D5T0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atad1Q9D5T0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atad1Q9D5T0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atad1Q9D5T0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atad1Q9D5T0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atad1Q9D5T0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Atad1Q9D5T0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atad1Q9D5T0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atad1Q9D5T0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atad1Q9D5T0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atad1Q9D5T0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atad1Q9D5T0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atad1Q9D5T0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atad1Q9D5T0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atad1Q9D5T0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atad1Q9D5T0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atad1Q9D5T0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atad1Q9D5T0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atad1Q9D5T0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atad1Q9D5T0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atad1Q9D5T0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atad1Q9D5T0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atad1Q9D5T0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atad1Q9D5T0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atad1Q9D5T0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atad1Q9D5T0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atad1Q9D5T0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atad1Q9D5T0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atad1Q9D5T0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Atad1Q9D5T0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atad1Q9D5T0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atad1Q9D5T0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atad1Q9D5T0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Atad1Q9D5T0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atad1Q9D5T0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atad1Q9D5T0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atad1Q9D5T0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atad1Q9D5T0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Atad1Q9D5T0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atad1Q9D5T0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atad1Q9D5T0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atad1Q9D5T0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atad1Q9D5T0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atad1Q9D5T0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atad1Q9D5T0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atad1Q9D5T0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atad1Q9D5T0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atad1Q9D5T0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Atad1Q9D5T0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Atad1Q9D5T0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atad1Q9D5T0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atad1Q9D5T0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atad1Q9D5T0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atad1Q9D5T0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atad1Q9D5T0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atad1Q9D5T0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atad1Q9D5T0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atad1Q9D5T0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Atad1Q9D5T0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atad1Q9D5T0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atad1Q9D5T0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atad1Q9D5T0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Atad1Q9D5T0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atad1Q9D5T0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Atad1Q9D5T0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atad1Q9D5T0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atad1Q9D5T0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atad1Q9D5T0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atad1Q9D5T0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atad1Q9D5T0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atad1Q9D5T0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atad1Q9D5T0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atad1Q9D5T0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atad1Q9D5T0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms