Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5L7

Spsb1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb1Q9D5L7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spsb1Q9D5L7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spsb1Q9D5L7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spsb1Q9D5L7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spsb1Q9D5L7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spsb1Q9D5L7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spsb1Q9D5L7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spsb1Q9D5L7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spsb1Q9D5L7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spsb1Q9D5L7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spsb1Q9D5L7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spsb1Q9D5L7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spsb1Q9D5L7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spsb1Q9D5L7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spsb1Q9D5L7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spsb1Q9D5L7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spsb1Q9D5L7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spsb1Q9D5L7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spsb1Q9D5L7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spsb1Q9D5L7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spsb1Q9D5L7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spsb1Q9D5L7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spsb1Q9D5L7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spsb1Q9D5L7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spsb1Q9D5L7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spsb1Q9D5L7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spsb1Q9D5L7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spsb1Q9D5L7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spsb1Q9D5L7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spsb1Q9D5L7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spsb1Q9D5L7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spsb1Q9D5L7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spsb1Q9D5L7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spsb1Q9D5L7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Spsb1Q9D5L7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spsb1Q9D5L7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spsb1Q9D5L7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spsb1Q9D5L7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spsb1Q9D5L7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spsb1Q9D5L7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spsb1Q9D5L7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spsb1Q9D5L7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spsb1Q9D5L7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spsb1Q9D5L7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spsb1Q9D5L7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spsb1Q9D5L7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spsb1Q9D5L7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spsb1Q9D5L7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spsb1Q9D5L7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spsb1Q9D5L7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spsb1Q9D5L7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spsb1Q9D5L7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spsb1Q9D5L7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spsb1Q9D5L7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spsb1Q9D5L7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Spsb1Q9D5L7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spsb1Q9D5L7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spsb1Q9D5L7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spsb1Q9D5L7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spsb1Q9D5L7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spsb1Q9D5L7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spsb1Q9D5L7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spsb1Q9D5L7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spsb1Q9D5L7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spsb1Q9D5L7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spsb1Q9D5L7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spsb1Q9D5L7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spsb1Q9D5L7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spsb1Q9D5L7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spsb1Q9D5L7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spsb1Q9D5L7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spsb1Q9D5L7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spsb1Q9D5L7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spsb1Q9D5L7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spsb1Q9D5L7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spsb1Q9D5L7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spsb1Q9D5L7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Spsb1Q9D5L7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spsb1Q9D5L7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Spsb1Q9D5L7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spsb1Q9D5L7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spsb1Q9D5L7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spsb1Q9D5L7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spsb1Q9D5L7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spsb1Q9D5L7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spsb1Q9D5L7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spsb1Q9D5L7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spsb1Q9D5L7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spsb1Q9D5L7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spsb1Q9D5L7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spsb1Q9D5L7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spsb1Q9D5L7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spsb1Q9D5L7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spsb1Q9D5L7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spsb1Q9D5L7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Spsb1Q9D5L7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spsb1Q9D5L7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spsb1Q9D5L7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spsb1Q9D5L7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spsb1Q9D5L7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms