Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930449I24RikQ9D5E3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930449I24RikQ9D5E3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930449I24RikQ9D5E3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930449I24RikQ9D5E3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930449I24RikQ9D5E3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930449I24RikQ9D5E3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930449I24RikQ9D5E3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930449I24RikQ9D5E3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930449I24RikQ9D5E3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930449I24RikQ9D5E3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930449I24RikQ9D5E3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930449I24RikQ9D5E3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930449I24RikQ9D5E3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930449I24RikQ9D5E3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930449I24RikQ9D5E3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
4930449I24RikQ9D5E3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
4930449I24RikQ9D5E3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930449I24RikQ9D5E3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930449I24RikQ9D5E3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930449I24RikQ9D5E3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930449I24RikQ9D5E3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930449I24RikQ9D5E3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930449I24RikQ9D5E3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930449I24RikQ9D5E3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4930449I24RikQ9D5E3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4930449I24RikQ9D5E3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4930449I24RikQ9D5E3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4930449I24RikQ9D5E3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4930449I24RikQ9D5E3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4930449I24RikQ9D5E3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930449I24RikQ9D5E3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930449I24RikQ9D5E3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
4930449I24RikQ9D5E3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930449I24RikQ9D5E3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930449I24RikQ9D5E3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930449I24RikQ9D5E3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930449I24RikQ9D5E3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930449I24RikQ9D5E3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930449I24RikQ9D5E3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930449I24RikQ9D5E3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
4930449I24RikQ9D5E3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930449I24RikQ9D5E3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930449I24RikQ9D5E3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4930449I24RikQ9D5E3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4930449I24RikQ9D5E3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4930449I24RikQ9D5E3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4930449I24RikQ9D5E3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4930449I24RikQ9D5E3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
4930449I24RikQ9D5E3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
4930449I24RikQ9D5E3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
4930449I24RikQ9D5E3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
4930449I24RikQ9D5E3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930449I24RikQ9D5E3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930449I24RikQ9D5E3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930449I24RikQ9D5E3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930449I24RikQ9D5E3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930449I24RikQ9D5E3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4930449I24RikQ9D5E3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4930449I24RikQ9D5E3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
4930449I24RikQ9D5E3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4930449I24RikQ9D5E3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4930449I24RikQ9D5E3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4930449I24RikQ9D5E3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930449I24RikQ9D5E3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930449I24RikQ9D5E3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930449I24RikQ9D5E3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930449I24RikQ9D5E3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930449I24RikQ9D5E3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930449I24RikQ9D5E3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930449I24RikQ9D5E3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930449I24RikQ9D5E3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930449I24RikQ9D5E3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930449I24RikQ9D5E3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930449I24RikQ9D5E3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930449I24RikQ9D5E3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930449I24RikQ9D5E3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930449I24RikQ9D5E3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930449I24RikQ9D5E3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930449I24RikQ9D5E3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930449I24RikQ9D5E3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930449I24RikQ9D5E3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930449I24RikQ9D5E3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930449I24RikQ9D5E3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930449I24RikQ9D5E3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930449I24RikQ9D5E3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930449I24RikQ9D5E3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930449I24RikQ9D5E3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930449I24RikQ9D5E3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930449I24RikQ9D5E3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930449I24RikQ9D5E3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930449I24RikQ9D5E3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
4930449I24RikQ9D5E3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
4930449I24RikQ9D5E3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4930449I24RikQ9D5E3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4930449I24RikQ9D5E3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4930449I24RikQ9D5E3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4930449I24RikQ9D5E3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms