Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V7

Rabl3, Rab-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl3Q9D4V7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rabl3Q9D4V7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rabl3Q9D4V7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rabl3Q9D4V7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rabl3Q9D4V7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rabl3Q9D4V7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rabl3Q9D4V7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rabl3Q9D4V7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rabl3Q9D4V7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rabl3Q9D4V7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rabl3Q9D4V7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rabl3Q9D4V7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rabl3Q9D4V7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rabl3Q9D4V7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rabl3Q9D4V7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rabl3Q9D4V7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rabl3Q9D4V7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rabl3Q9D4V7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rabl3Q9D4V7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rabl3Q9D4V7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rabl3Q9D4V7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rabl3Q9D4V7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rabl3Q9D4V7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rabl3Q9D4V7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rabl3Q9D4V7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rabl3Q9D4V7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rabl3Q9D4V7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rabl3Q9D4V7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rabl3Q9D4V7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rabl3Q9D4V7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rabl3Q9D4V7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rabl3Q9D4V7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rabl3Q9D4V7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rabl3Q9D4V7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rabl3Q9D4V7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rabl3Q9D4V7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rabl3Q9D4V7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rabl3Q9D4V7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rabl3Q9D4V7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rabl3Q9D4V7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rabl3Q9D4V7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rabl3Q9D4V7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rabl3Q9D4V7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rabl3Q9D4V7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rabl3Q9D4V7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rabl3Q9D4V7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rabl3Q9D4V7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rabl3Q9D4V7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rabl3Q9D4V7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rabl3Q9D4V7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rabl3Q9D4V7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rabl3Q9D4V7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rabl3Q9D4V7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rabl3Q9D4V7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rabl3Q9D4V7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rabl3Q9D4V7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rabl3Q9D4V7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rabl3Q9D4V7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rabl3Q9D4V7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rabl3Q9D4V7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rabl3Q9D4V7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rabl3Q9D4V7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rabl3Q9D4V7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rabl3Q9D4V7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rabl3Q9D4V7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rabl3Q9D4V7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rabl3Q9D4V7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rabl3Q9D4V7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rabl3Q9D4V7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rabl3Q9D4V7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rabl3Q9D4V7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rabl3Q9D4V7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rabl3Q9D4V7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rabl3Q9D4V7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rabl3Q9D4V7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rabl3Q9D4V7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Rabl3Q9D4V7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rabl3Q9D4V7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rabl3Q9D4V7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rabl3Q9D4V7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rabl3Q9D4V7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rabl3Q9D4V7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rabl3Q9D4V7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rabl3Q9D4V7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rabl3Q9D4V7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rabl3Q9D4V7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rabl3Q9D4V7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rabl3Q9D4V7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rabl3Q9D4V7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rabl3Q9D4V7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rabl3Q9D4V7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rabl3Q9D4V7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rabl3Q9D4V7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rabl3Q9D4V7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rabl3Q9D4V7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rabl3Q9D4V7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rabl3Q9D4V7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rabl3Q9D4V7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rabl3Q9D4V7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rabl3Q9D4V7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms