Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q4

4930578G10Rik, RIKEN cDNA 4930578G10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930578G10RikQ9D4Q4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930578G10RikQ9D4Q4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930578G10RikQ9D4Q4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930578G10RikQ9D4Q4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930578G10RikQ9D4Q4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930578G10RikQ9D4Q4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
4930578G10RikQ9D4Q4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930578G10RikQ9D4Q4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930578G10RikQ9D4Q4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930578G10RikQ9D4Q4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930578G10RikQ9D4Q4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930578G10RikQ9D4Q4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930578G10RikQ9D4Q4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930578G10RikQ9D4Q4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930578G10RikQ9D4Q4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930578G10RikQ9D4Q4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930578G10RikQ9D4Q4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930578G10RikQ9D4Q4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930578G10RikQ9D4Q4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930578G10RikQ9D4Q4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930578G10RikQ9D4Q4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930578G10RikQ9D4Q4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
4930578G10RikQ9D4Q4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930578G10RikQ9D4Q4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930578G10RikQ9D4Q4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930578G10RikQ9D4Q4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930578G10RikQ9D4Q4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930578G10RikQ9D4Q4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930578G10RikQ9D4Q4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930578G10RikQ9D4Q4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930578G10RikQ9D4Q4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930578G10RikQ9D4Q4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930578G10RikQ9D4Q4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930578G10RikQ9D4Q4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930578G10RikQ9D4Q4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930578G10RikQ9D4Q4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930578G10RikQ9D4Q4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930578G10RikQ9D4Q4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930578G10RikQ9D4Q4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930578G10RikQ9D4Q4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930578G10RikQ9D4Q4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930578G10RikQ9D4Q4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930578G10RikQ9D4Q4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
4930578G10RikQ9D4Q4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
4930578G10RikQ9D4Q4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930578G10RikQ9D4Q4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930578G10RikQ9D4Q4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930578G10RikQ9D4Q4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930578G10RikQ9D4Q4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930578G10RikQ9D4Q4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
4930578G10RikQ9D4Q4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
4930578G10RikQ9D4Q4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930578G10RikQ9D4Q4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930578G10RikQ9D4Q4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930578G10RikQ9D4Q4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930578G10RikQ9D4Q4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930578G10RikQ9D4Q4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930578G10RikQ9D4Q4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930578G10RikQ9D4Q4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
4930578G10RikQ9D4Q4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930578G10RikQ9D4Q4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930578G10RikQ9D4Q4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930578G10RikQ9D4Q4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930578G10RikQ9D4Q4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930578G10RikQ9D4Q4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930578G10RikQ9D4Q4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930578G10RikQ9D4Q4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930578G10RikQ9D4Q4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930578G10RikQ9D4Q4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930578G10RikQ9D4Q4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930578G10RikQ9D4Q4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930578G10RikQ9D4Q4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930578G10RikQ9D4Q4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930578G10RikQ9D4Q4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930578G10RikQ9D4Q4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930578G10RikQ9D4Q4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930578G10RikQ9D4Q4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930578G10RikQ9D4Q4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
4930578G10RikQ9D4Q4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930578G10RikQ9D4Q4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930578G10RikQ9D4Q4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
4930578G10RikQ9D4Q4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930578G10RikQ9D4Q4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930578G10RikQ9D4Q4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930578G10RikQ9D4Q4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930578G10RikQ9D4Q4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
4930578G10RikQ9D4Q4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930578G10RikQ9D4Q4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930578G10RikQ9D4Q4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
4930578G10RikQ9D4Q4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms