Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phf6Q9D4J7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phf6Q9D4J7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Phf6Q9D4J7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Phf6Q9D4J7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Phf6Q9D4J7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Phf6Q9D4J7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Phf6Q9D4J7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Phf6Q9D4J7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Phf6Q9D4J7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Phf6Q9D4J7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Phf6Q9D4J7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Phf6Q9D4J7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Phf6Q9D4J7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Phf6Q9D4J7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Phf6Q9D4J7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Phf6Q9D4J7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Phf6Q9D4J7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Phf6Q9D4J7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Phf6Q9D4J7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Phf6Q9D4J7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Phf6Q9D4J7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Phf6Q9D4J7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Phf6Q9D4J7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Phf6Q9D4J7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Phf6Q9D4J7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Phf6Q9D4J7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Phf6Q9D4J7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Phf6Q9D4J7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Phf6Q9D4J7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Phf6Q9D4J7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Phf6Q9D4J7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Phf6Q9D4J7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Phf6Q9D4J7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Phf6Q9D4J7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Phf6Q9D4J7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Phf6Q9D4J7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Phf6Q9D4J7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Phf6Q9D4J7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Phf6Q9D4J7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Phf6Q9D4J7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Phf6Q9D4J7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Phf6Q9D4J7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Phf6Q9D4J7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Phf6Q9D4J7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Phf6Q9D4J7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Phf6Q9D4J7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Phf6Q9D4J7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Phf6Q9D4J7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Phf6Q9D4J7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Phf6Q9D4J7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Phf6Q9D4J7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Phf6Q9D4J7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Phf6Q9D4J7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Phf6Q9D4J7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Phf6Q9D4J7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Phf6Q9D4J7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Phf6Q9D4J7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Phf6Q9D4J7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Phf6Q9D4J7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Phf6Q9D4J7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Phf6Q9D4J7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Phf6Q9D4J7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Phf6Q9D4J7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Phf6Q9D4J7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Phf6Q9D4J7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Phf6Q9D4J7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Phf6Q9D4J7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Phf6Q9D4J7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Phf6Q9D4J7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Phf6Q9D4J7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Phf6Q9D4J7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Phf6Q9D4J7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Phf6Q9D4J7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Phf6Q9D4J7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Phf6Q9D4J7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Phf6Q9D4J7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Phf6Q9D4J7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Phf6Q9D4J7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Phf6Q9D4J7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Phf6Q9D4J7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Phf6Q9D4J7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Phf6Q9D4J7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Phf6Q9D4J7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Phf6Q9D4J7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Phf6Q9D4J7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Phf6Q9D4J7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Phf6Q9D4J7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Phf6Q9D4J7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Phf6Q9D4J7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Phf6Q9D4J7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Phf6Q9D4J7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Phf6Q9D4J7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Phf6Q9D4J7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Phf6Q9D4J7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Phf6Q9D4J7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Phf6Q9D4J7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Phf6Q9D4J7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Phf6Q9D4J7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Phf6Q9D4J7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.5 ms