Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4933425L06RikQ9D3Z8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
4933425L06RikQ9D3Z8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4933425L06RikQ9D3Z8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4933425L06RikQ9D3Z8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
4933425L06RikQ9D3Z8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
4933425L06RikQ9D3Z8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4933425L06RikQ9D3Z8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4933425L06RikQ9D3Z8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4933425L06RikQ9D3Z8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933425L06RikQ9D3Z8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933425L06RikQ9D3Z8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933425L06RikQ9D3Z8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933425L06RikQ9D3Z8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
4933425L06RikQ9D3Z8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933425L06RikQ9D3Z8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933425L06RikQ9D3Z8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933425L06RikQ9D3Z8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933425L06RikQ9D3Z8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4933425L06RikQ9D3Z8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4933425L06RikQ9D3Z8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4933425L06RikQ9D3Z8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
4933425L06RikQ9D3Z8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4933425L06RikQ9D3Z8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4933425L06RikQ9D3Z8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4933425L06RikQ9D3Z8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4933425L06RikQ9D3Z8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
4933425L06RikQ9D3Z8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4933425L06RikQ9D3Z8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4933425L06RikQ9D3Z8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
4933425L06RikQ9D3Z8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4933425L06RikQ9D3Z8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
4933425L06RikQ9D3Z8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
4933425L06RikQ9D3Z8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4933425L06RikQ9D3Z8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
4933425L06RikQ9D3Z8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4933425L06RikQ9D3Z8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4933425L06RikQ9D3Z8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
4933425L06RikQ9D3Z8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4933425L06RikQ9D3Z8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
4933425L06RikQ9D3Z8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
4933425L06RikQ9D3Z8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
4933425L06RikQ9D3Z8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
4933425L06RikQ9D3Z8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
4933425L06RikQ9D3Z8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
4933425L06RikQ9D3Z8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
4933425L06RikQ9D3Z8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
4933425L06RikQ9D3Z8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
4933425L06RikQ9D3Z8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
4933425L06RikQ9D3Z8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
4933425L06RikQ9D3Z8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
4933425L06RikQ9D3Z8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933425L06RikQ9D3Z8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933425L06RikQ9D3Z8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933425L06RikQ9D3Z8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933425L06RikQ9D3Z8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933425L06RikQ9D3Z8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933425L06RikQ9D3Z8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
4933425L06RikQ9D3Z8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4933425L06RikQ9D3Z8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
4933425L06RikQ9D3Z8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4933425L06RikQ9D3Z8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
4933425L06RikQ9D3Z8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4933425L06RikQ9D3Z8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
4933425L06RikQ9D3Z8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4933425L06RikQ9D3Z8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4933425L06RikQ9D3Z8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4933425L06RikQ9D3Z8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4933425L06RikQ9D3Z8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4933425L06RikQ9D3Z8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4933425L06RikQ9D3Z8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
4933425L06RikQ9D3Z8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4933425L06RikQ9D3Z8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4933425L06RikQ9D3Z8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
4933425L06RikQ9D3Z8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4933425L06RikQ9D3Z8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4933425L06RikQ9D3Z8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4933425L06RikQ9D3Z8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4933425L06RikQ9D3Z8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4933425L06RikQ9D3Z8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4933425L06RikQ9D3Z8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4933425L06RikQ9D3Z8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
4933425L06RikQ9D3Z8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
4933425L06RikQ9D3Z8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4933425L06RikQ9D3Z8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4933425L06RikQ9D3Z8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms