Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rsph14Q9D3W1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rsph14Q9D3W1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rsph14Q9D3W1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rsph14Q9D3W1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rsph14Q9D3W1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rsph14Q9D3W1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rsph14Q9D3W1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rsph14Q9D3W1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rsph14Q9D3W1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rsph14Q9D3W1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rsph14Q9D3W1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rsph14Q9D3W1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rsph14Q9D3W1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rsph14Q9D3W1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rsph14Q9D3W1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rsph14Q9D3W1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rsph14Q9D3W1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rsph14Q9D3W1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rsph14Q9D3W1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rsph14Q9D3W1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rsph14Q9D3W1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rsph14Q9D3W1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rsph14Q9D3W1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rsph14Q9D3W1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rsph14Q9D3W1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rsph14Q9D3W1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rsph14Q9D3W1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rsph14Q9D3W1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rsph14Q9D3W1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rsph14Q9D3W1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Rsph14Q9D3W1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rsph14Q9D3W1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rsph14Q9D3W1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rsph14Q9D3W1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rsph14Q9D3W1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rsph14Q9D3W1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rsph14Q9D3W1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rsph14Q9D3W1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rsph14Q9D3W1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rsph14Q9D3W1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rsph14Q9D3W1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rsph14Q9D3W1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rsph14Q9D3W1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rsph14Q9D3W1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rsph14Q9D3W1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rsph14Q9D3W1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rsph14Q9D3W1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rsph14Q9D3W1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rsph14Q9D3W1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rsph14Q9D3W1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rsph14Q9D3W1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rsph14Q9D3W1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rsph14Q9D3W1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rsph14Q9D3W1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rsph14Q9D3W1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rsph14Q9D3W1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rsph14Q9D3W1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rsph14Q9D3W1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rsph14Q9D3W1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rsph14Q9D3W1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rsph14Q9D3W1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rsph14Q9D3W1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rsph14Q9D3W1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rsph14Q9D3W1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rsph14Q9D3W1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rsph14Q9D3W1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rsph14Q9D3W1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rsph14Q9D3W1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rsph14Q9D3W1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rsph14Q9D3W1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rsph14Q9D3W1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rsph14Q9D3W1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rsph14Q9D3W1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rsph14Q9D3W1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rsph14Q9D3W1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rsph14Q9D3W1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rsph14Q9D3W1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rsph14Q9D3W1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rsph14Q9D3W1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rsph14Q9D3W1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rsph14Q9D3W1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rsph14Q9D3W1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rsph14Q9D3W1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rsph14Q9D3W1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rsph14Q9D3W1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rsph14Q9D3W1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rsph14Q9D3W1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rsph14Q9D3W1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rsph14Q9D3W1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rsph14Q9D3W1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rsph14Q9D3W1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rsph14Q9D3W1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rsph14Q9D3W1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rsph14Q9D3W1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rsph14Q9D3W1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rsph14Q9D3W1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rsph14Q9D3W1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rsph14Q9D3W1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rsph14Q9D3W1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms