Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx29Q9D3S3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx29Q9D3S3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx29Q9D3S3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx29Q9D3S3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx29Q9D3S3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx29Q9D3S3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx29Q9D3S3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx29Q9D3S3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx29Q9D3S3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx29Q9D3S3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx29Q9D3S3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx29Q9D3S3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx29Q9D3S3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx29Q9D3S3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx29Q9D3S3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx29Q9D3S3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx29Q9D3S3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx29Q9D3S3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx29Q9D3S3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx29Q9D3S3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx29Q9D3S3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx29Q9D3S3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx29Q9D3S3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx29Q9D3S3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx29Q9D3S3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx29Q9D3S3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx29Q9D3S3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snx29Q9D3S3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snx29Q9D3S3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snx29Q9D3S3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snx29Q9D3S3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snx29Q9D3S3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Snx29Q9D3S3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snx29Q9D3S3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snx29Q9D3S3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snx29Q9D3S3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx29Q9D3S3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx29Q9D3S3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx29Q9D3S3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx29Q9D3S3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx29Q9D3S3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx29Q9D3S3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx29Q9D3S3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx29Q9D3S3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx29Q9D3S3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx29Q9D3S3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx29Q9D3S3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx29Q9D3S3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx29Q9D3S3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx29Q9D3S3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx29Q9D3S3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx29Q9D3S3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx29Q9D3S3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx29Q9D3S3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx29Q9D3S3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx29Q9D3S3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx29Q9D3S3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx29Q9D3S3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx29Q9D3S3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx29Q9D3S3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snx29Q9D3S3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snx29Q9D3S3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snx29Q9D3S3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snx29Q9D3S3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snx29Q9D3S3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snx29Q9D3S3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snx29Q9D3S3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx29Q9D3S3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx29Q9D3S3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx29Q9D3S3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx29Q9D3S3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx29Q9D3S3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx29Q9D3S3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx29Q9D3S3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx29Q9D3S3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx29Q9D3S3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx29Q9D3S3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx29Q9D3S3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx29Q9D3S3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx29Q9D3S3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx29Q9D3S3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snx29Q9D3S3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snx29Q9D3S3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snx29Q9D3S3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snx29Q9D3S3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snx29Q9D3S3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx29Q9D3S3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx29Q9D3S3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx29Q9D3S3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx29Q9D3S3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx29Q9D3S3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx29Q9D3S3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx29Q9D3S3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx29Q9D3S3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx29Q9D3S3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snx29Q9D3S3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Snx29Q9D3S3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx29Q9D3S3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx29Q9D3S3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms