Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Stag1Q9D3E6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Stag1Q9D3E6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Stag1Q9D3E6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Stag1Q9D3E6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Stag1Q9D3E6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Stag1Q9D3E6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Stag1Q9D3E6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Stag1Q9D3E6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Stag1Q9D3E6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Stag1Q9D3E6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Stag1Q9D3E6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Stag1Q9D3E6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Stag1Q9D3E6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Stag1Q9D3E6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stag1Q9D3E6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stag1Q9D3E6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Stag1Q9D3E6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stag1Q9D3E6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stag1Q9D3E6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stag1Q9D3E6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stag1Q9D3E6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stag1Q9D3E6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stag1Q9D3E6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stag1Q9D3E6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stag1Q9D3E6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stag1Q9D3E6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stag1Q9D3E6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Stag1Q9D3E6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Stag1Q9D3E6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Stag1Q9D3E6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Stag1Q9D3E6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Stag1Q9D3E6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Stag1Q9D3E6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Stag1Q9D3E6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Stag1Q9D3E6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Stag1Q9D3E6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Stag1Q9D3E6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Stag1Q9D3E6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Stag1Q9D3E6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Stag1Q9D3E6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stag1Q9D3E6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stag1Q9D3E6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stag1Q9D3E6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Stag1Q9D3E6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Stag1Q9D3E6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Stag1Q9D3E6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Stag1Q9D3E6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stag1Q9D3E6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Stag1Q9D3E6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stag1Q9D3E6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stag1Q9D3E6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stag1Q9D3E6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stag1Q9D3E6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stag1Q9D3E6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Stag1Q9D3E6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stag1Q9D3E6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stag1Q9D3E6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Stag1Q9D3E6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Stag1Q9D3E6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Stag1Q9D3E6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Stag1Q9D3E6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Stag1Q9D3E6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Stag1Q9D3E6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Stag1Q9D3E6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Stag1Q9D3E6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Stag1Q9D3E6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Stag1Q9D3E6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Stag1Q9D3E6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Stag1Q9D3E6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Stag1Q9D3E6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Stag1Q9D3E6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Stag1Q9D3E6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Stag1Q9D3E6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Stag1Q9D3E6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Stag1Q9D3E6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Stag1Q9D3E6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Stag1Q9D3E6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Stag1Q9D3E6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Stag1Q9D3E6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Stag1Q9D3E6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Stag1Q9D3E6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Stag1Q9D3E6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Stag1Q9D3E6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Stag1Q9D3E6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Stag1Q9D3E6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Stag1Q9D3E6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Stag1Q9D3E6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Stag1Q9D3E6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Stag1Q9D3E6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Stag1Q9D3E6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Stag1Q9D3E6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Stag1Q9D3E6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Stag1Q9D3E6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Stag1Q9D3E6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Stag1Q9D3E6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Stag1Q9D3E6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Stag1Q9D3E6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Stag1Q9D3E6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Stag1Q9D3E6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms