Protein–RNA interactions for Protein: Q9D253

9330161L09Rik, RIKEN cDNA 9330161L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9330161L09RikQ9D253 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
9330161L09RikQ9D253 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
9330161L09RikQ9D253 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
9330161L09RikQ9D253 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
9330161L09RikQ9D253 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
9330161L09RikQ9D253 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
9330161L09RikQ9D253 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
9330161L09RikQ9D253 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
9330161L09RikQ9D253 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
9330161L09RikQ9D253 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
9330161L09RikQ9D253 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
9330161L09RikQ9D253 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
9330161L09RikQ9D253 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
9330161L09RikQ9D253 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
9330161L09RikQ9D253 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
9330161L09RikQ9D253 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
9330161L09RikQ9D253 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
9330161L09RikQ9D253 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
9330161L09RikQ9D253 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
9330161L09RikQ9D253 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
9330161L09RikQ9D253 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
9330161L09RikQ9D253 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
9330161L09RikQ9D253 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
9330161L09RikQ9D253 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
9330161L09RikQ9D253 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
9330161L09RikQ9D253 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
9330161L09RikQ9D253 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
9330161L09RikQ9D253 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
9330161L09RikQ9D253 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
9330161L09RikQ9D253 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
9330161L09RikQ9D253 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
9330161L09RikQ9D253 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
9330161L09RikQ9D253 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
9330161L09RikQ9D253 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
9330161L09RikQ9D253 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
9330161L09RikQ9D253 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
9330161L09RikQ9D253 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
9330161L09RikQ9D253 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
9330161L09RikQ9D253 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
9330161L09RikQ9D253 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
9330161L09RikQ9D253 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
9330161L09RikQ9D253 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
9330161L09RikQ9D253 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
9330161L09RikQ9D253 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
9330161L09RikQ9D253 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
9330161L09RikQ9D253 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
9330161L09RikQ9D253 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
9330161L09RikQ9D253 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
9330161L09RikQ9D253 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
9330161L09RikQ9D253 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
9330161L09RikQ9D253 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
9330161L09RikQ9D253 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
9330161L09RikQ9D253 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
9330161L09RikQ9D253 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
9330161L09RikQ9D253 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
9330161L09RikQ9D253 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
9330161L09RikQ9D253 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
9330161L09RikQ9D253 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
9330161L09RikQ9D253 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
9330161L09RikQ9D253 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
9330161L09RikQ9D253 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
9330161L09RikQ9D253 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
9330161L09RikQ9D253 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
9330161L09RikQ9D253 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
9330161L09RikQ9D253 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
9330161L09RikQ9D253 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
9330161L09RikQ9D253 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
9330161L09RikQ9D253 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
9330161L09RikQ9D253 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
9330161L09RikQ9D253 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
9330161L09RikQ9D253 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
9330161L09RikQ9D253 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
9330161L09RikQ9D253 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
9330161L09RikQ9D253 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
9330161L09RikQ9D253 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
9330161L09RikQ9D253 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
9330161L09RikQ9D253 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
9330161L09RikQ9D253 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
9330161L09RikQ9D253 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
9330161L09RikQ9D253 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
9330161L09RikQ9D253 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
9330161L09RikQ9D253 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
9330161L09RikQ9D253 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
9330161L09RikQ9D253 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
9330161L09RikQ9D253 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
9330161L09RikQ9D253 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
9330161L09RikQ9D253 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
9330161L09RikQ9D253 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
9330161L09RikQ9D253 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
9330161L09RikQ9D253 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
9330161L09RikQ9D253 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
9330161L09RikQ9D253 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
9330161L09RikQ9D253 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
9330161L09RikQ9D253 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
9330161L09RikQ9D253 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
9330161L09RikQ9D253 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
9330161L09RikQ9D253 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
9330161L09RikQ9D253 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
9330161L09RikQ9D253 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
9330161L09RikQ9D253 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms