Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Y9

Shisal2b, Protein shisa-like-2B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2bQ9D1Y9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shisal2bQ9D1Y9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shisal2bQ9D1Y9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shisal2bQ9D1Y9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Shisal2bQ9D1Y9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shisal2bQ9D1Y9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shisal2bQ9D1Y9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shisal2bQ9D1Y9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shisal2bQ9D1Y9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shisal2bQ9D1Y9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shisal2bQ9D1Y9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shisal2bQ9D1Y9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shisal2bQ9D1Y9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shisal2bQ9D1Y9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shisal2bQ9D1Y9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shisal2bQ9D1Y9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shisal2bQ9D1Y9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shisal2bQ9D1Y9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shisal2bQ9D1Y9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shisal2bQ9D1Y9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Shisal2bQ9D1Y9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shisal2bQ9D1Y9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shisal2bQ9D1Y9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shisal2bQ9D1Y9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shisal2bQ9D1Y9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shisal2bQ9D1Y9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shisal2bQ9D1Y9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shisal2bQ9D1Y9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shisal2bQ9D1Y9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shisal2bQ9D1Y9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shisal2bQ9D1Y9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shisal2bQ9D1Y9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shisal2bQ9D1Y9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shisal2bQ9D1Y9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shisal2bQ9D1Y9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Shisal2bQ9D1Y9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shisal2bQ9D1Y9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shisal2bQ9D1Y9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shisal2bQ9D1Y9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shisal2bQ9D1Y9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shisal2bQ9D1Y9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shisal2bQ9D1Y9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shisal2bQ9D1Y9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shisal2bQ9D1Y9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shisal2bQ9D1Y9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shisal2bQ9D1Y9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shisal2bQ9D1Y9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shisal2bQ9D1Y9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shisal2bQ9D1Y9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shisal2bQ9D1Y9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shisal2bQ9D1Y9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shisal2bQ9D1Y9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shisal2bQ9D1Y9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shisal2bQ9D1Y9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shisal2bQ9D1Y9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Shisal2bQ9D1Y9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shisal2bQ9D1Y9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shisal2bQ9D1Y9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shisal2bQ9D1Y9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shisal2bQ9D1Y9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shisal2bQ9D1Y9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shisal2bQ9D1Y9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shisal2bQ9D1Y9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shisal2bQ9D1Y9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisal2bQ9D1Y9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisal2bQ9D1Y9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisal2bQ9D1Y9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisal2bQ9D1Y9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisal2bQ9D1Y9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisal2bQ9D1Y9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisal2bQ9D1Y9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisal2bQ9D1Y9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisal2bQ9D1Y9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisal2bQ9D1Y9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisal2bQ9D1Y9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisal2bQ9D1Y9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisal2bQ9D1Y9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisal2bQ9D1Y9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisal2bQ9D1Y9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisal2bQ9D1Y9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisal2bQ9D1Y9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisal2bQ9D1Y9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shisal2bQ9D1Y9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shisal2bQ9D1Y9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shisal2bQ9D1Y9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shisal2bQ9D1Y9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shisal2bQ9D1Y9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shisal2bQ9D1Y9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shisal2bQ9D1Y9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shisal2bQ9D1Y9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Shisal2bQ9D1Y9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisal2bQ9D1Y9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisal2bQ9D1Y9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisal2bQ9D1Y9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisal2bQ9D1Y9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisal2bQ9D1Y9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisal2bQ9D1Y9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisal2bQ9D1Y9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisal2bQ9D1Y9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisal2bQ9D1Y9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms