Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Q4

Dpm3, Dolichol-phosphate mannosyltransferase subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpm3Q9D1Q4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Dpm3Q9D1Q4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dpm3Q9D1Q4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dpm3Q9D1Q4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dpm3Q9D1Q4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dpm3Q9D1Q4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dpm3Q9D1Q4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dpm3Q9D1Q4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dpm3Q9D1Q4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dpm3Q9D1Q4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dpm3Q9D1Q4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dpm3Q9D1Q4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dpm3Q9D1Q4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dpm3Q9D1Q4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dpm3Q9D1Q4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dpm3Q9D1Q4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dpm3Q9D1Q4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Dpm3Q9D1Q4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dpm3Q9D1Q4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dpm3Q9D1Q4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dpm3Q9D1Q4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Dpm3Q9D1Q4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dpm3Q9D1Q4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dpm3Q9D1Q4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dpm3Q9D1Q4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dpm3Q9D1Q4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dpm3Q9D1Q4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dpm3Q9D1Q4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dpm3Q9D1Q4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dpm3Q9D1Q4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dpm3Q9D1Q4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dpm3Q9D1Q4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dpm3Q9D1Q4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dpm3Q9D1Q4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dpm3Q9D1Q4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dpm3Q9D1Q4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dpm3Q9D1Q4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dpm3Q9D1Q4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dpm3Q9D1Q4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms