Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J1

Necap2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necap2Q9D1J1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Necap2Q9D1J1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms