Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl53Q9D1H8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mrpl53Q9D1H8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl53Q9D1H8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl53Q9D1H8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl53Q9D1H8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl53Q9D1H8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl53Q9D1H8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl53Q9D1H8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl53Q9D1H8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl53Q9D1H8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl53Q9D1H8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl53Q9D1H8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl53Q9D1H8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl53Q9D1H8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl53Q9D1H8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl53Q9D1H8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl53Q9D1H8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl53Q9D1H8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl53Q9D1H8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl53Q9D1H8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl53Q9D1H8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl53Q9D1H8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl53Q9D1H8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl53Q9D1H8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl53Q9D1H8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl53Q9D1H8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl53Q9D1H8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl53Q9D1H8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl53Q9D1H8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl53Q9D1H8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl53Q9D1H8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl53Q9D1H8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl53Q9D1H8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl53Q9D1H8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl53Q9D1H8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl53Q9D1H8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl53Q9D1H8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl53Q9D1H8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl53Q9D1H8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl53Q9D1H8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl53Q9D1H8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl53Q9D1H8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl53Q9D1H8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl53Q9D1H8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl53Q9D1H8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl53Q9D1H8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl53Q9D1H8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl53Q9D1H8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl53Q9D1H8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl53Q9D1H8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl53Q9D1H8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl53Q9D1H8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl53Q9D1H8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl53Q9D1H8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl53Q9D1H8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl53Q9D1H8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl53Q9D1H8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl53Q9D1H8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl53Q9D1H8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl53Q9D1H8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl53Q9D1H8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl53Q9D1H8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl53Q9D1H8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl53Q9D1H8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl53Q9D1H8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl53Q9D1H8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl53Q9D1H8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl53Q9D1H8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl53Q9D1H8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl53Q9D1H8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl53Q9D1H8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl53Q9D1H8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl53Q9D1H8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl53Q9D1H8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl53Q9D1H8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl53Q9D1H8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl53Q9D1H8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl53Q9D1H8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl53Q9D1H8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl53Q9D1H8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl53Q9D1H8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms