Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mrpl28Q9D1B9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mrpl28Q9D1B9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mrpl28Q9D1B9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mrpl28Q9D1B9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mrpl28Q9D1B9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mrpl28Q9D1B9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrpl28Q9D1B9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrpl28Q9D1B9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrpl28Q9D1B9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrpl28Q9D1B9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrpl28Q9D1B9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrpl28Q9D1B9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrpl28Q9D1B9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrpl28Q9D1B9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrpl28Q9D1B9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrpl28Q9D1B9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrpl28Q9D1B9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrpl28Q9D1B9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrpl28Q9D1B9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrpl28Q9D1B9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrpl28Q9D1B9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrpl28Q9D1B9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrpl28Q9D1B9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrpl28Q9D1B9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrpl28Q9D1B9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrpl28Q9D1B9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrpl28Q9D1B9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrpl28Q9D1B9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrpl28Q9D1B9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrpl28Q9D1B9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl28Q9D1B9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl28Q9D1B9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl28Q9D1B9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl28Q9D1B9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl28Q9D1B9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl28Q9D1B9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl28Q9D1B9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl28Q9D1B9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl28Q9D1B9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl28Q9D1B9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl28Q9D1B9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl28Q9D1B9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl28Q9D1B9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl28Q9D1B9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl28Q9D1B9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl28Q9D1B9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl28Q9D1B9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl28Q9D1B9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl28Q9D1B9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl28Q9D1B9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl28Q9D1B9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl28Q9D1B9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl28Q9D1B9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl28Q9D1B9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl28Q9D1B9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl28Q9D1B9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl28Q9D1B9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mrpl28Q9D1B9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mrpl28Q9D1B9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mrpl28Q9D1B9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mrpl28Q9D1B9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mrpl28Q9D1B9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl28Q9D1B9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl28Q9D1B9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl28Q9D1B9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl28Q9D1B9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl28Q9D1B9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl28Q9D1B9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl28Q9D1B9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl28Q9D1B9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl28Q9D1B9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl28Q9D1B9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl28Q9D1B9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl28Q9D1B9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl28Q9D1B9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl28Q9D1B9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl28Q9D1B9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl28Q9D1B9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl28Q9D1B9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl28Q9D1B9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl28Q9D1B9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl28Q9D1B9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl28Q9D1B9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl28Q9D1B9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl28Q9D1B9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl28Q9D1B9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl28Q9D1B9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl28Q9D1B9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl28Q9D1B9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl28Q9D1B9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl28Q9D1B9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl28Q9D1B9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl28Q9D1B9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl28Q9D1B9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl28Q9D1B9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl28Q9D1B9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl28Q9D1B9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl28Q9D1B9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl28Q9D1B9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.4 ms