Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zbed3Q9D0L1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Zbed3Q9D0L1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zbed3Q9D0L1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Zbed3Q9D0L1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zbed3Q9D0L1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zbed3Q9D0L1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zbed3Q9D0L1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zbed3Q9D0L1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zbed3Q9D0L1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zbed3Q9D0L1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zbed3Q9D0L1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zbed3Q9D0L1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zbed3Q9D0L1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zbed3Q9D0L1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zbed3Q9D0L1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zbed3Q9D0L1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zbed3Q9D0L1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zbed3Q9D0L1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zbed3Q9D0L1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zbed3Q9D0L1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Zbed3Q9D0L1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zbed3Q9D0L1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zbed3Q9D0L1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zbed3Q9D0L1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zbed3Q9D0L1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zbed3Q9D0L1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zbed3Q9D0L1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zbed3Q9D0L1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zbed3Q9D0L1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zbed3Q9D0L1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zbed3Q9D0L1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zbed3Q9D0L1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zbed3Q9D0L1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zbed3Q9D0L1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zbed3Q9D0L1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zbed3Q9D0L1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zbed3Q9D0L1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zbed3Q9D0L1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zbed3Q9D0L1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zbed3Q9D0L1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zbed3Q9D0L1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zbed3Q9D0L1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zbed3Q9D0L1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zbed3Q9D0L1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zbed3Q9D0L1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zbed3Q9D0L1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zbed3Q9D0L1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zbed3Q9D0L1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zbed3Q9D0L1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zbed3Q9D0L1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zbed3Q9D0L1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zbed3Q9D0L1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zbed3Q9D0L1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zbed3Q9D0L1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zbed3Q9D0L1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zbed3Q9D0L1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zbed3Q9D0L1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Zbed3Q9D0L1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zbed3Q9D0L1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zbed3Q9D0L1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Zbed3Q9D0L1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zbed3Q9D0L1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zbed3Q9D0L1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zbed3Q9D0L1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zbed3Q9D0L1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zbed3Q9D0L1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zbed3Q9D0L1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zbed3Q9D0L1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zbed3Q9D0L1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zbed3Q9D0L1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zbed3Q9D0L1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zbed3Q9D0L1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zbed3Q9D0L1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zbed3Q9D0L1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zbed3Q9D0L1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zbed3Q9D0L1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zbed3Q9D0L1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Zbed3Q9D0L1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zbed3Q9D0L1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zbed3Q9D0L1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zbed3Q9D0L1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zbed3Q9D0L1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zbed3Q9D0L1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zbed3Q9D0L1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zbed3Q9D0L1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zbed3Q9D0L1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zbed3Q9D0L1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zbed3Q9D0L1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zbed3Q9D0L1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zbed3Q9D0L1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zbed3Q9D0L1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zbed3Q9D0L1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zbed3Q9D0L1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zbed3Q9D0L1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zbed3Q9D0L1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zbed3Q9D0L1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zbed3Q9D0L1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zbed3Q9D0L1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zbed3Q9D0L1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
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