Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F4

Nkap, NF-kappa-B-activating protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NkapQ9D0F4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NkapQ9D0F4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NkapQ9D0F4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NkapQ9D0F4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NkapQ9D0F4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NkapQ9D0F4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NkapQ9D0F4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NkapQ9D0F4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NkapQ9D0F4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NkapQ9D0F4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NkapQ9D0F4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NkapQ9D0F4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NkapQ9D0F4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NkapQ9D0F4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NkapQ9D0F4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NkapQ9D0F4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NkapQ9D0F4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NkapQ9D0F4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NkapQ9D0F4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NkapQ9D0F4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NkapQ9D0F4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NkapQ9D0F4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NkapQ9D0F4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NkapQ9D0F4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NkapQ9D0F4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NkapQ9D0F4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NkapQ9D0F4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NkapQ9D0F4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NkapQ9D0F4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NkapQ9D0F4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NkapQ9D0F4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NkapQ9D0F4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NkapQ9D0F4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NkapQ9D0F4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NkapQ9D0F4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NkapQ9D0F4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NkapQ9D0F4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NkapQ9D0F4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NkapQ9D0F4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NkapQ9D0F4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NkapQ9D0F4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NkapQ9D0F4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NkapQ9D0F4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NkapQ9D0F4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NkapQ9D0F4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NkapQ9D0F4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NkapQ9D0F4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NkapQ9D0F4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NkapQ9D0F4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NkapQ9D0F4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NkapQ9D0F4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NkapQ9D0F4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NkapQ9D0F4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NkapQ9D0F4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NkapQ9D0F4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NkapQ9D0F4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NkapQ9D0F4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NkapQ9D0F4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NkapQ9D0F4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NkapQ9D0F4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NkapQ9D0F4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NkapQ9D0F4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NkapQ9D0F4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NkapQ9D0F4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NkapQ9D0F4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NkapQ9D0F4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NkapQ9D0F4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NkapQ9D0F4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NkapQ9D0F4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NkapQ9D0F4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NkapQ9D0F4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NkapQ9D0F4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NkapQ9D0F4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NkapQ9D0F4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NkapQ9D0F4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NkapQ9D0F4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NkapQ9D0F4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NkapQ9D0F4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NkapQ9D0F4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NkapQ9D0F4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NkapQ9D0F4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NkapQ9D0F4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NkapQ9D0F4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NkapQ9D0F4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NkapQ9D0F4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NkapQ9D0F4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NkapQ9D0F4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NkapQ9D0F4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NkapQ9D0F4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NkapQ9D0F4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NkapQ9D0F4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NkapQ9D0F4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NkapQ9D0F4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NkapQ9D0F4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NkapQ9D0F4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NkapQ9D0F4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NkapQ9D0F4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NkapQ9D0F4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NkapQ9D0F4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NkapQ9D0F4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms