Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mms19Q9D071 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mms19Q9D071 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mms19Q9D071 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mms19Q9D071 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mms19Q9D071 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mms19Q9D071 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mms19Q9D071 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mms19Q9D071 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mms19Q9D071 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mms19Q9D071 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mms19Q9D071 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mms19Q9D071 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mms19Q9D071 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mms19Q9D071 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mms19Q9D071 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mms19Q9D071 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mms19Q9D071 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mms19Q9D071 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mms19Q9D071 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mms19Q9D071 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mms19Q9D071 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mms19Q9D071 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Mms19Q9D071 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mms19Q9D071 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mms19Q9D071 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mms19Q9D071 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mms19Q9D071 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Mms19Q9D071 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mms19Q9D071 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mms19Q9D071 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mms19Q9D071 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mms19Q9D071 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mms19Q9D071 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mms19Q9D071 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mms19Q9D071 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mms19Q9D071 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mms19Q9D071 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mms19Q9D071 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mms19Q9D071 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mms19Q9D071 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mms19Q9D071 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mms19Q9D071 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Mms19Q9D071 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mms19Q9D071 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mms19Q9D071 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Mms19Q9D071 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mms19Q9D071 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mms19Q9D071 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Mms19Q9D071 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mms19Q9D071 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mms19Q9D071 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mms19Q9D071 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mms19Q9D071 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mms19Q9D071 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mms19Q9D071 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mms19Q9D071 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mms19Q9D071 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mms19Q9D071 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Mms19Q9D071 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Mms19Q9D071 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mms19Q9D071 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mms19Q9D071 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mms19Q9D071 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mms19Q9D071 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Mms19Q9D071 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mms19Q9D071 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mms19Q9D071 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mms19Q9D071 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mms19Q9D071 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mms19Q9D071 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mms19Q9D071 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mms19Q9D071 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Mms19Q9D071 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mms19Q9D071 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mms19Q9D071 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mms19Q9D071 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mms19Q9D071 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mms19Q9D071 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mms19Q9D071 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mms19Q9D071 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mms19Q9D071 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mms19Q9D071 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mms19Q9D071 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mms19Q9D071 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mms19Q9D071 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mms19Q9D071 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mms19Q9D071 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mms19Q9D071 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mms19Q9D071 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mms19Q9D071 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mms19Q9D071 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mms19Q9D071 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mms19Q9D071 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mms19Q9D071 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mms19Q9D071 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mms19Q9D071 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Mms19Q9D071 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mms19Q9D071 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mms19Q9D071 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms