Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW2

Cenpn, Centromere protein N, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpnQ9CZW2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CenpnQ9CZW2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CenpnQ9CZW2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CenpnQ9CZW2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CenpnQ9CZW2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CenpnQ9CZW2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CenpnQ9CZW2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CenpnQ9CZW2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CenpnQ9CZW2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CenpnQ9CZW2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CenpnQ9CZW2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CenpnQ9CZW2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CenpnQ9CZW2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CenpnQ9CZW2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CenpnQ9CZW2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CenpnQ9CZW2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CenpnQ9CZW2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CenpnQ9CZW2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CenpnQ9CZW2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CenpnQ9CZW2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CenpnQ9CZW2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CenpnQ9CZW2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CenpnQ9CZW2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CenpnQ9CZW2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CenpnQ9CZW2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CenpnQ9CZW2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CenpnQ9CZW2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CenpnQ9CZW2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CenpnQ9CZW2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CenpnQ9CZW2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CenpnQ9CZW2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CenpnQ9CZW2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CenpnQ9CZW2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CenpnQ9CZW2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CenpnQ9CZW2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CenpnQ9CZW2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CenpnQ9CZW2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CenpnQ9CZW2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CenpnQ9CZW2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CenpnQ9CZW2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CenpnQ9CZW2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CenpnQ9CZW2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CenpnQ9CZW2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CenpnQ9CZW2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CenpnQ9CZW2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CenpnQ9CZW2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CenpnQ9CZW2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CenpnQ9CZW2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CenpnQ9CZW2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CenpnQ9CZW2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CenpnQ9CZW2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CenpnQ9CZW2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CenpnQ9CZW2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CenpnQ9CZW2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CenpnQ9CZW2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CenpnQ9CZW2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CenpnQ9CZW2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CenpnQ9CZW2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CenpnQ9CZW2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CenpnQ9CZW2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CenpnQ9CZW2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CenpnQ9CZW2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CenpnQ9CZW2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CenpnQ9CZW2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CenpnQ9CZW2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CenpnQ9CZW2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CenpnQ9CZW2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CenpnQ9CZW2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CenpnQ9CZW2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CenpnQ9CZW2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CenpnQ9CZW2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CenpnQ9CZW2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CenpnQ9CZW2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CenpnQ9CZW2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CenpnQ9CZW2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CenpnQ9CZW2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CenpnQ9CZW2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CenpnQ9CZW2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CenpnQ9CZW2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CenpnQ9CZW2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CenpnQ9CZW2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CenpnQ9CZW2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CenpnQ9CZW2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CenpnQ9CZW2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CenpnQ9CZW2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CenpnQ9CZW2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CenpnQ9CZW2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CenpnQ9CZW2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CenpnQ9CZW2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CenpnQ9CZW2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CenpnQ9CZW2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CenpnQ9CZW2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CenpnQ9CZW2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CenpnQ9CZW2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CenpnQ9CZW2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CenpnQ9CZW2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CenpnQ9CZW2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CenpnQ9CZW2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CenpnQ9CZW2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CenpnQ9CZW2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms