Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT6

Cmss1, Protein CMSS1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmss1Q9CZT6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cmss1Q9CZT6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cmss1Q9CZT6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cmss1Q9CZT6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cmss1Q9CZT6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmss1Q9CZT6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmss1Q9CZT6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmss1Q9CZT6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmss1Q9CZT6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmss1Q9CZT6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmss1Q9CZT6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmss1Q9CZT6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmss1Q9CZT6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmss1Q9CZT6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmss1Q9CZT6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmss1Q9CZT6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmss1Q9CZT6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmss1Q9CZT6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmss1Q9CZT6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmss1Q9CZT6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmss1Q9CZT6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmss1Q9CZT6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmss1Q9CZT6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmss1Q9CZT6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmss1Q9CZT6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmss1Q9CZT6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmss1Q9CZT6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmss1Q9CZT6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmss1Q9CZT6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmss1Q9CZT6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cmss1Q9CZT6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cmss1Q9CZT6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cmss1Q9CZT6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cmss1Q9CZT6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cmss1Q9CZT6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cmss1Q9CZT6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cmss1Q9CZT6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmss1Q9CZT6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cmss1Q9CZT6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmss1Q9CZT6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmss1Q9CZT6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms