Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZR4

Cmtm8, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm8Q9CZR4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cmtm8Q9CZR4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cmtm8Q9CZR4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cmtm8Q9CZR4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cmtm8Q9CZR4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cmtm8Q9CZR4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cmtm8Q9CZR4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cmtm8Q9CZR4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cmtm8Q9CZR4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cmtm8Q9CZR4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cmtm8Q9CZR4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cmtm8Q9CZR4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cmtm8Q9CZR4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cmtm8Q9CZR4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cmtm8Q9CZR4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cmtm8Q9CZR4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cmtm8Q9CZR4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cmtm8Q9CZR4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cmtm8Q9CZR4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cmtm8Q9CZR4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cmtm8Q9CZR4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cmtm8Q9CZR4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cmtm8Q9CZR4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cmtm8Q9CZR4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cmtm8Q9CZR4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cmtm8Q9CZR4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cmtm8Q9CZR4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cmtm8Q9CZR4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cmtm8Q9CZR4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cmtm8Q9CZR4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cmtm8Q9CZR4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cmtm8Q9CZR4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cmtm8Q9CZR4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cmtm8Q9CZR4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cmtm8Q9CZR4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cmtm8Q9CZR4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cmtm8Q9CZR4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cmtm8Q9CZR4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cmtm8Q9CZR4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cmtm8Q9CZR4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cmtm8Q9CZR4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cmtm8Q9CZR4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cmtm8Q9CZR4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cmtm8Q9CZR4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cmtm8Q9CZR4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cmtm8Q9CZR4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cmtm8Q9CZR4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cmtm8Q9CZR4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cmtm8Q9CZR4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cmtm8Q9CZR4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cmtm8Q9CZR4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cmtm8Q9CZR4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cmtm8Q9CZR4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cmtm8Q9CZR4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cmtm8Q9CZR4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cmtm8Q9CZR4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cmtm8Q9CZR4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cmtm8Q9CZR4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cmtm8Q9CZR4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cmtm8Q9CZR4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cmtm8Q9CZR4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cmtm8Q9CZR4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cmtm8Q9CZR4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cmtm8Q9CZR4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cmtm8Q9CZR4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cmtm8Q9CZR4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cmtm8Q9CZR4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cmtm8Q9CZR4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cmtm8Q9CZR4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cmtm8Q9CZR4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cmtm8Q9CZR4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cmtm8Q9CZR4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cmtm8Q9CZR4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cmtm8Q9CZR4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cmtm8Q9CZR4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cmtm8Q9CZR4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cmtm8Q9CZR4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cmtm8Q9CZR4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cmtm8Q9CZR4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cmtm8Q9CZR4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cmtm8Q9CZR4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Cmtm8Q9CZR4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cmtm8Q9CZR4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cmtm8Q9CZR4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cmtm8Q9CZR4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cmtm8Q9CZR4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cmtm8Q9CZR4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cmtm8Q9CZR4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cmtm8Q9CZR4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cmtm8Q9CZR4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cmtm8Q9CZR4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cmtm8Q9CZR4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cmtm8Q9CZR4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cmtm8Q9CZR4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cmtm8Q9CZR4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cmtm8Q9CZR4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cmtm8Q9CZR4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cmtm8Q9CZR4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cmtm8Q9CZR4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cmtm8Q9CZR4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms