Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ44

Nsfl1c, NSFL1 cofactor p47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsfl1cQ9CZ44 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nsfl1cQ9CZ44 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nsfl1cQ9CZ44 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nsfl1cQ9CZ44 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Nsfl1cQ9CZ44 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nsfl1cQ9CZ44 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nsfl1cQ9CZ44 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nsfl1cQ9CZ44 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nsfl1cQ9CZ44 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nsfl1cQ9CZ44 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nsfl1cQ9CZ44 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nsfl1cQ9CZ44 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nsfl1cQ9CZ44 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nsfl1cQ9CZ44 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nsfl1cQ9CZ44 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nsfl1cQ9CZ44 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nsfl1cQ9CZ44 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nsfl1cQ9CZ44 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nsfl1cQ9CZ44 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nsfl1cQ9CZ44 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nsfl1cQ9CZ44 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nsfl1cQ9CZ44 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nsfl1cQ9CZ44 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nsfl1cQ9CZ44 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nsfl1cQ9CZ44 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nsfl1cQ9CZ44 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nsfl1cQ9CZ44 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nsfl1cQ9CZ44 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nsfl1cQ9CZ44 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Nsfl1cQ9CZ44 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Nsfl1cQ9CZ44 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nsfl1cQ9CZ44 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nsfl1cQ9CZ44 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nsfl1cQ9CZ44 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nsfl1cQ9CZ44 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nsfl1cQ9CZ44 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nsfl1cQ9CZ44 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nsfl1cQ9CZ44 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nsfl1cQ9CZ44 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nsfl1cQ9CZ44 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nsfl1cQ9CZ44 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nsfl1cQ9CZ44 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nsfl1cQ9CZ44 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nsfl1cQ9CZ44 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nsfl1cQ9CZ44 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nsfl1cQ9CZ44 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nsfl1cQ9CZ44 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nsfl1cQ9CZ44 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nsfl1cQ9CZ44 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nsfl1cQ9CZ44 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nsfl1cQ9CZ44 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nsfl1cQ9CZ44 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nsfl1cQ9CZ44 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nsfl1cQ9CZ44 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nsfl1cQ9CZ44 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Nsfl1cQ9CZ44 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nsfl1cQ9CZ44 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nsfl1cQ9CZ44 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nsfl1cQ9CZ44 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nsfl1cQ9CZ44 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nsfl1cQ9CZ44 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nsfl1cQ9CZ44 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nsfl1cQ9CZ44 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nsfl1cQ9CZ44 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nsfl1cQ9CZ44 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nsfl1cQ9CZ44 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nsfl1cQ9CZ44 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nsfl1cQ9CZ44 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Nsfl1cQ9CZ44 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nsfl1cQ9CZ44 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nsfl1cQ9CZ44 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nsfl1cQ9CZ44 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nsfl1cQ9CZ44 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nsfl1cQ9CZ44 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nsfl1cQ9CZ44 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nsfl1cQ9CZ44 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nsfl1cQ9CZ44 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nsfl1cQ9CZ44 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nsfl1cQ9CZ44 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nsfl1cQ9CZ44 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Nsfl1cQ9CZ44 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Nsfl1cQ9CZ44 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nsfl1cQ9CZ44 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nsfl1cQ9CZ44 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nsfl1cQ9CZ44 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nsfl1cQ9CZ44 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nsfl1cQ9CZ44 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nsfl1cQ9CZ44 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nsfl1cQ9CZ44 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nsfl1cQ9CZ44 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Nsfl1cQ9CZ44 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nsfl1cQ9CZ44 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nsfl1cQ9CZ44 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nsfl1cQ9CZ44 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nsfl1cQ9CZ44 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nsfl1cQ9CZ44 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nsfl1cQ9CZ44 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nsfl1cQ9CZ44 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nsfl1cQ9CZ44 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nsfl1cQ9CZ44 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms