Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY50

Ssr1, Translocon-associated protein subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr1Q9CY50 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ssr1Q9CY50 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ssr1Q9CY50 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ssr1Q9CY50 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ssr1Q9CY50 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ssr1Q9CY50 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ssr1Q9CY50 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ssr1Q9CY50 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ssr1Q9CY50 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ssr1Q9CY50 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ssr1Q9CY50 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ssr1Q9CY50 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ssr1Q9CY50 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ssr1Q9CY50 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ssr1Q9CY50 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ssr1Q9CY50 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ssr1Q9CY50 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ssr1Q9CY50 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ssr1Q9CY50 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ssr1Q9CY50 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssr1Q9CY50 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssr1Q9CY50 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssr1Q9CY50 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssr1Q9CY50 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssr1Q9CY50 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssr1Q9CY50 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssr1Q9CY50 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssr1Q9CY50 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssr1Q9CY50 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssr1Q9CY50 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssr1Q9CY50 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssr1Q9CY50 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssr1Q9CY50 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssr1Q9CY50 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssr1Q9CY50 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssr1Q9CY50 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssr1Q9CY50 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssr1Q9CY50 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssr1Q9CY50 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssr1Q9CY50 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssr1Q9CY50 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssr1Q9CY50 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ssr1Q9CY50 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ssr1Q9CY50 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ssr1Q9CY50 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ssr1Q9CY50 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssr1Q9CY50 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssr1Q9CY50 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssr1Q9CY50 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssr1Q9CY50 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssr1Q9CY50 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssr1Q9CY50 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssr1Q9CY50 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssr1Q9CY50 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssr1Q9CY50 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssr1Q9CY50 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssr1Q9CY50 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssr1Q9CY50 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssr1Q9CY50 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssr1Q9CY50 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssr1Q9CY50 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssr1Q9CY50 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssr1Q9CY50 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssr1Q9CY50 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssr1Q9CY50 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssr1Q9CY50 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssr1Q9CY50 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssr1Q9CY50 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssr1Q9CY50 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssr1Q9CY50 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssr1Q9CY50 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssr1Q9CY50 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssr1Q9CY50 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssr1Q9CY50 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssr1Q9CY50 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssr1Q9CY50 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ssr1Q9CY50 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ssr1Q9CY50 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ssr1Q9CY50 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ssr1Q9CY50 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ssr1Q9CY50 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ssr1Q9CY50 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssr1Q9CY50 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssr1Q9CY50 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssr1Q9CY50 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssr1Q9CY50 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssr1Q9CY50 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ssr1Q9CY50 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssr1Q9CY50 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssr1Q9CY50 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssr1Q9CY50 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssr1Q9CY50 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssr1Q9CY50 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssr1Q9CY50 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssr1Q9CY50 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssr1Q9CY50 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssr1Q9CY50 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssr1Q9CY50 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssr1Q9CY50 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssr1Q9CY50 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms