Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx7Q9CY18 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx7Q9CY18 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx7Q9CY18 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx7Q9CY18 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx7Q9CY18 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx7Q9CY18 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx7Q9CY18 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx7Q9CY18 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx7Q9CY18 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx7Q9CY18 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx7Q9CY18 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx7Q9CY18 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx7Q9CY18 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx7Q9CY18 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx7Q9CY18 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx7Q9CY18 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx7Q9CY18 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx7Q9CY18 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx7Q9CY18 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx7Q9CY18 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx7Q9CY18 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Snx7Q9CY18 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Snx7Q9CY18 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx7Q9CY18 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx7Q9CY18 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx7Q9CY18 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx7Q9CY18 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx7Q9CY18 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx7Q9CY18 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx7Q9CY18 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx7Q9CY18 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx7Q9CY18 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx7Q9CY18 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx7Q9CY18 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx7Q9CY18 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx7Q9CY18 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx7Q9CY18 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx7Q9CY18 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx7Q9CY18 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx7Q9CY18 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx7Q9CY18 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx7Q9CY18 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx7Q9CY18 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx7Q9CY18 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx7Q9CY18 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx7Q9CY18 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx7Q9CY18 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx7Q9CY18 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx7Q9CY18 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx7Q9CY18 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx7Q9CY18 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx7Q9CY18 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx7Q9CY18 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx7Q9CY18 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx7Q9CY18 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx7Q9CY18 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx7Q9CY18 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx7Q9CY18 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx7Q9CY18 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx7Q9CY18 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx7Q9CY18 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx7Q9CY18 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx7Q9CY18 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx7Q9CY18 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx7Q9CY18 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx7Q9CY18 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx7Q9CY18 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx7Q9CY18 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx7Q9CY18 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx7Q9CY18 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx7Q9CY18 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx7Q9CY18 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx7Q9CY18 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx7Q9CY18 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx7Q9CY18 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx7Q9CY18 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx7Q9CY18 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx7Q9CY18 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx7Q9CY18 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Snx7Q9CY18 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Snx7Q9CY18 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Snx7Q9CY18 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Snx7Q9CY18 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx7Q9CY18 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Snx7Q9CY18 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx7Q9CY18 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Snx7Q9CY18 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Snx7Q9CY18 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx7Q9CY18 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx7Q9CY18 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Snx7Q9CY18 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx7Q9CY18 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx7Q9CY18 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx7Q9CY18 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx7Q9CY18 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx7Q9CY18 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Snx7Q9CY18 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx7Q9CY18 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx7Q9CY18 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms