Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nip7Q9CXK8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nip7Q9CXK8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nip7Q9CXK8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nip7Q9CXK8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nip7Q9CXK8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nip7Q9CXK8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nip7Q9CXK8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nip7Q9CXK8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Nip7Q9CXK8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Nip7Q9CXK8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nip7Q9CXK8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nip7Q9CXK8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Nip7Q9CXK8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nip7Q9CXK8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nip7Q9CXK8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nip7Q9CXK8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nip7Q9CXK8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Nip7Q9CXK8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Nip7Q9CXK8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nip7Q9CXK8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nip7Q9CXK8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nip7Q9CXK8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Nip7Q9CXK8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nip7Q9CXK8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nip7Q9CXK8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nip7Q9CXK8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nip7Q9CXK8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nip7Q9CXK8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nip7Q9CXK8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nip7Q9CXK8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nip7Q9CXK8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nip7Q9CXK8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nip7Q9CXK8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Nip7Q9CXK8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nip7Q9CXK8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nip7Q9CXK8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nip7Q9CXK8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nip7Q9CXK8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nip7Q9CXK8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nip7Q9CXK8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nip7Q9CXK8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nip7Q9CXK8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nip7Q9CXK8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Nip7Q9CXK8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nip7Q9CXK8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nip7Q9CXK8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nip7Q9CXK8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nip7Q9CXK8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nip7Q9CXK8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nip7Q9CXK8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nip7Q9CXK8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nip7Q9CXK8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nip7Q9CXK8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nip7Q9CXK8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nip7Q9CXK8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nip7Q9CXK8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nip7Q9CXK8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nip7Q9CXK8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nip7Q9CXK8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nip7Q9CXK8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nip7Q9CXK8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Nip7Q9CXK8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nip7Q9CXK8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nip7Q9CXK8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nip7Q9CXK8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nip7Q9CXK8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nip7Q9CXK8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nip7Q9CXK8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nip7Q9CXK8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nip7Q9CXK8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Nip7Q9CXK8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nip7Q9CXK8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nip7Q9CXK8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nip7Q9CXK8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nip7Q9CXK8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nip7Q9CXK8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nip7Q9CXK8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nip7Q9CXK8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Nip7Q9CXK8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nip7Q9CXK8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nip7Q9CXK8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nip7Q9CXK8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Nip7Q9CXK8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nip7Q9CXK8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nip7Q9CXK8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nip7Q9CXK8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nip7Q9CXK8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nip7Q9CXK8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nip7Q9CXK8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nip7Q9CXK8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nip7Q9CXK8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nip7Q9CXK8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nip7Q9CXK8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nip7Q9CXK8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nip7Q9CXK8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nip7Q9CXK8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nip7Q9CXK8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nip7Q9CXK8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nip7Q9CXK8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms