Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpusd4Q9CWX4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpusd4Q9CWX4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpusd4Q9CWX4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpusd4Q9CWX4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpusd4Q9CWX4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpusd4Q9CWX4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpusd4Q9CWX4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpusd4Q9CWX4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpusd4Q9CWX4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpusd4Q9CWX4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpusd4Q9CWX4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpusd4Q9CWX4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpusd4Q9CWX4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpusd4Q9CWX4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpusd4Q9CWX4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpusd4Q9CWX4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpusd4Q9CWX4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpusd4Q9CWX4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpusd4Q9CWX4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpusd4Q9CWX4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpusd4Q9CWX4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpusd4Q9CWX4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpusd4Q9CWX4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpusd4Q9CWX4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpusd4Q9CWX4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpusd4Q9CWX4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpusd4Q9CWX4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpusd4Q9CWX4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpusd4Q9CWX4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpusd4Q9CWX4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpusd4Q9CWX4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpusd4Q9CWX4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpusd4Q9CWX4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpusd4Q9CWX4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpusd4Q9CWX4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpusd4Q9CWX4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpusd4Q9CWX4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpusd4Q9CWX4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpusd4Q9CWX4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpusd4Q9CWX4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpusd4Q9CWX4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpusd4Q9CWX4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpusd4Q9CWX4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpusd4Q9CWX4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpusd4Q9CWX4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpusd4Q9CWX4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpusd4Q9CWX4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpusd4Q9CWX4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpusd4Q9CWX4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpusd4Q9CWX4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpusd4Q9CWX4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpusd4Q9CWX4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpusd4Q9CWX4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpusd4Q9CWX4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpusd4Q9CWX4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpusd4Q9CWX4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpusd4Q9CWX4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpusd4Q9CWX4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpusd4Q9CWX4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpusd4Q9CWX4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpusd4Q9CWX4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpusd4Q9CWX4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpusd4Q9CWX4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd4Q9CWX4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd4Q9CWX4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd4Q9CWX4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd4Q9CWX4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd4Q9CWX4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd4Q9CWX4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd4Q9CWX4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd4Q9CWX4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd4Q9CWX4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd4Q9CWX4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpusd4Q9CWX4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpusd4Q9CWX4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpusd4Q9CWX4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpusd4Q9CWX4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpusd4Q9CWX4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpusd4Q9CWX4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpusd4Q9CWX4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpusd4Q9CWX4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpusd4Q9CWX4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpusd4Q9CWX4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpusd4Q9CWX4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpusd4Q9CWX4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpusd4Q9CWX4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpusd4Q9CWX4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpusd4Q9CWX4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpusd4Q9CWX4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpusd4Q9CWX4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpusd4Q9CWX4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpusd4Q9CWX4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpusd4Q9CWX4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpusd4Q9CWX4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpusd4Q9CWX4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd4Q9CWX4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd4Q9CWX4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd4Q9CWX4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd4Q9CWX4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 189.5 ms