Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Malsu1Q9CWV0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Malsu1Q9CWV0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Malsu1Q9CWV0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Malsu1Q9CWV0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Malsu1Q9CWV0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Malsu1Q9CWV0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Malsu1Q9CWV0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Malsu1Q9CWV0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Malsu1Q9CWV0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Malsu1Q9CWV0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Malsu1Q9CWV0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Malsu1Q9CWV0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Malsu1Q9CWV0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Malsu1Q9CWV0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Malsu1Q9CWV0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Malsu1Q9CWV0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Malsu1Q9CWV0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Malsu1Q9CWV0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Malsu1Q9CWV0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Malsu1Q9CWV0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Malsu1Q9CWV0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Malsu1Q9CWV0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Malsu1Q9CWV0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Malsu1Q9CWV0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Malsu1Q9CWV0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Malsu1Q9CWV0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Malsu1Q9CWV0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Malsu1Q9CWV0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Malsu1Q9CWV0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Malsu1Q9CWV0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Malsu1Q9CWV0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Malsu1Q9CWV0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Malsu1Q9CWV0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Malsu1Q9CWV0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Malsu1Q9CWV0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Malsu1Q9CWV0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Malsu1Q9CWV0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Malsu1Q9CWV0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Malsu1Q9CWV0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Malsu1Q9CWV0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Malsu1Q9CWV0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Malsu1Q9CWV0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Malsu1Q9CWV0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Malsu1Q9CWV0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Malsu1Q9CWV0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Malsu1Q9CWV0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Malsu1Q9CWV0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Malsu1Q9CWV0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Malsu1Q9CWV0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Malsu1Q9CWV0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Malsu1Q9CWV0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Malsu1Q9CWV0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Malsu1Q9CWV0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Malsu1Q9CWV0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Malsu1Q9CWV0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Malsu1Q9CWV0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Malsu1Q9CWV0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Malsu1Q9CWV0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Malsu1Q9CWV0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Malsu1Q9CWV0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Malsu1Q9CWV0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Malsu1Q9CWV0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Malsu1Q9CWV0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Malsu1Q9CWV0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Malsu1Q9CWV0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Malsu1Q9CWV0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Malsu1Q9CWV0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Malsu1Q9CWV0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Malsu1Q9CWV0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Malsu1Q9CWV0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Malsu1Q9CWV0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Malsu1Q9CWV0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Malsu1Q9CWV0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Malsu1Q9CWV0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Malsu1Q9CWV0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Malsu1Q9CWV0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Malsu1Q9CWV0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Malsu1Q9CWV0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Malsu1Q9CWV0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Malsu1Q9CWV0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Malsu1Q9CWV0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Malsu1Q9CWV0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Malsu1Q9CWV0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Malsu1Q9CWV0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Malsu1Q9CWV0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Malsu1Q9CWV0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Malsu1Q9CWV0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Malsu1Q9CWV0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Malsu1Q9CWV0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Malsu1Q9CWV0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Malsu1Q9CWV0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Malsu1Q9CWV0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Malsu1Q9CWV0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Malsu1Q9CWV0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Malsu1Q9CWV0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Malsu1Q9CWV0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Malsu1Q9CWV0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Malsu1Q9CWV0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Malsu1Q9CWV0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms