Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx10Q9CWT3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx10Q9CWT3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx10Q9CWT3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx10Q9CWT3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx10Q9CWT3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx10Q9CWT3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx10Q9CWT3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx10Q9CWT3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx10Q9CWT3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx10Q9CWT3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx10Q9CWT3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx10Q9CWT3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx10Q9CWT3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx10Q9CWT3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx10Q9CWT3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx10Q9CWT3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx10Q9CWT3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx10Q9CWT3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx10Q9CWT3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx10Q9CWT3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx10Q9CWT3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx10Q9CWT3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx10Q9CWT3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx10Q9CWT3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx10Q9CWT3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx10Q9CWT3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx10Q9CWT3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx10Q9CWT3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx10Q9CWT3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx10Q9CWT3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx10Q9CWT3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx10Q9CWT3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx10Q9CWT3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx10Q9CWT3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx10Q9CWT3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx10Q9CWT3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx10Q9CWT3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx10Q9CWT3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx10Q9CWT3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx10Q9CWT3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx10Q9CWT3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx10Q9CWT3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx10Q9CWT3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx10Q9CWT3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx10Q9CWT3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx10Q9CWT3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx10Q9CWT3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx10Q9CWT3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx10Q9CWT3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx10Q9CWT3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx10Q9CWT3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx10Q9CWT3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx10Q9CWT3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx10Q9CWT3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx10Q9CWT3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx10Q9CWT3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx10Q9CWT3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx10Q9CWT3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx10Q9CWT3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx10Q9CWT3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx10Q9CWT3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx10Q9CWT3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx10Q9CWT3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx10Q9CWT3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx10Q9CWT3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx10Q9CWT3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx10Q9CWT3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx10Q9CWT3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx10Q9CWT3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx10Q9CWT3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx10Q9CWT3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx10Q9CWT3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx10Q9CWT3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx10Q9CWT3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx10Q9CWT3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx10Q9CWT3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx10Q9CWT3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx10Q9CWT3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx10Q9CWT3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx10Q9CWT3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx10Q9CWT3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx10Q9CWT3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx10Q9CWT3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx10Q9CWT3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx10Q9CWT3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx10Q9CWT3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Snx10Q9CWT3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Snx10Q9CWT3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Snx10Q9CWT3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Snx10Q9CWT3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx10Q9CWT3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx10Q9CWT3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx10Q9CWT3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx10Q9CWT3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx10Q9CWT3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx10Q9CWT3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx10Q9CWT3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx10Q9CWT3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx10Q9CWT3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.3 ms