Protein–RNA interactions for Protein: Q9CW03

Smc3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc3Q9CW03 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smc3Q9CW03 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smc3Q9CW03 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smc3Q9CW03 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smc3Q9CW03 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smc3Q9CW03 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smc3Q9CW03 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smc3Q9CW03 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smc3Q9CW03 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smc3Q9CW03 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smc3Q9CW03 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smc3Q9CW03 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smc3Q9CW03 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smc3Q9CW03 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smc3Q9CW03 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smc3Q9CW03 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smc3Q9CW03 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smc3Q9CW03 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smc3Q9CW03 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smc3Q9CW03 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smc3Q9CW03 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smc3Q9CW03 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smc3Q9CW03 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smc3Q9CW03 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smc3Q9CW03 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smc3Q9CW03 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smc3Q9CW03 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smc3Q9CW03 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smc3Q9CW03 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smc3Q9CW03 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smc3Q9CW03 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smc3Q9CW03 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smc3Q9CW03 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smc3Q9CW03 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Smc3Q9CW03 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Smc3Q9CW03 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smc3Q9CW03 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smc3Q9CW03 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smc3Q9CW03 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smc3Q9CW03 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smc3Q9CW03 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smc3Q9CW03 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smc3Q9CW03 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smc3Q9CW03 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smc3Q9CW03 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smc3Q9CW03 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smc3Q9CW03 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smc3Q9CW03 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smc3Q9CW03 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smc3Q9CW03 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smc3Q9CW03 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smc3Q9CW03 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smc3Q9CW03 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smc3Q9CW03 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smc3Q9CW03 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smc3Q9CW03 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smc3Q9CW03 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smc3Q9CW03 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smc3Q9CW03 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smc3Q9CW03 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smc3Q9CW03 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smc3Q9CW03 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smc3Q9CW03 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smc3Q9CW03 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smc3Q9CW03 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smc3Q9CW03 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smc3Q9CW03 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smc3Q9CW03 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smc3Q9CW03 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smc3Q9CW03 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smc3Q9CW03 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smc3Q9CW03 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smc3Q9CW03 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smc3Q9CW03 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smc3Q9CW03 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smc3Q9CW03 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smc3Q9CW03 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Smc3Q9CW03 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smc3Q9CW03 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smc3Q9CW03 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smc3Q9CW03 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smc3Q9CW03 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Smc3Q9CW03 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smc3Q9CW03 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smc3Q9CW03 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smc3Q9CW03 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smc3Q9CW03 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smc3Q9CW03 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smc3Q9CW03 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smc3Q9CW03 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smc3Q9CW03 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smc3Q9CW03 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smc3Q9CW03 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smc3Q9CW03 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smc3Q9CW03 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smc3Q9CW03 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smc3Q9CW03 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smc3Q9CW03 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smc3Q9CW03 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smc3Q9CW03 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms