Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Sycp2Q9CUU3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Sycp2Q9CUU3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Sycp2Q9CUU3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
Sycp2Q9CUU3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
Sycp2Q9CUU3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
Sycp2Q9CUU3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
Sycp2Q9CUU3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Sycp2Q9CUU3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Sycp2Q9CUU3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
Sycp2Q9CUU3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Sycp2Q9CUU3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Sycp2Q9CUU3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
Sycp2Q9CUU3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.42■■■■■ 4.06
Sycp2Q9CUU3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC40.42■■■■■ 4.06
Sycp2Q9CUU3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Sycp2Q9CUU3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC40.41■■■■■ 4.06
Sycp2Q9CUU3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Sycp2Q9CUU3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Sycp2Q9CUU3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Sycp2Q9CUU3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
Sycp2Q9CUU3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Sycp2Q9CUU3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
Sycp2Q9CUU3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
Sycp2Q9CUU3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC40.38■■■■■ 4.05
Sycp2Q9CUU3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
Sycp2Q9CUU3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Sycp2Q9CUU3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC40.37■■■■■ 4.05
Sycp2Q9CUU3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Sycp2Q9CUU3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Sycp2Q9CUU3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC40.37■■■■■ 4.05
Sycp2Q9CUU3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Sycp2Q9CUU3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Sycp2Q9CUU3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Sycp2Q9CUU3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Sycp2Q9CUU3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC40.34■■■■■ 4.05
Sycp2Q9CUU3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Sycp2Q9CUU3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
Sycp2Q9CUU3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
Sycp2Q9CUU3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
Sycp2Q9CUU3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
Sycp2Q9CUU3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
Sycp2Q9CUU3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Sycp2Q9CUU3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Sycp2Q9CUU3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC40.31■■■■■ 4.04
Sycp2Q9CUU3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Sycp2Q9CUU3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
Sycp2Q9CUU3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
Sycp2Q9CUU3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Sycp2Q9CUU3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC40.29■■■■■ 4.04
Sycp2Q9CUU3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Sycp2Q9CUU3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Sycp2Q9CUU3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
Sycp2Q9CUU3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Sycp2Q9CUU3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
Sycp2Q9CUU3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC40.26■■■■■ 4.04
Sycp2Q9CUU3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
Sycp2Q9CUU3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
Sycp2Q9CUU3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.26■■■■■ 4.03
Sycp2Q9CUU3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC40.26■■■■■ 4.03
Sycp2Q9CUU3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Sycp2Q9CUU3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
Sycp2Q9CUU3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
Sycp2Q9CUU3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Sycp2Q9CUU3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Sycp2Q9CUU3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Sycp2Q9CUU3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Sycp2Q9CUU3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Sycp2Q9CUU3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Sycp2Q9CUU3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.21■■■■■ 4.03
Sycp2Q9CUU3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
Sycp2Q9CUU3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC40.21■■■■■ 4.03
Sycp2Q9CUU3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
Sycp2Q9CUU3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
Sycp2Q9CUU3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Sycp2Q9CUU3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
Sycp2Q9CUU3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Sycp2Q9CUU3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC40.19■■■■■ 4.02
Sycp2Q9CUU3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Sycp2Q9CUU3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
Sycp2Q9CUU3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Sycp2Q9CUU3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Sycp2Q9CUU3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Sycp2Q9CUU3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Sycp2Q9CUU3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
Sycp2Q9CUU3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
Sycp2Q9CUU3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Sycp2Q9CUU3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Sycp2Q9CUU3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
Sycp2Q9CUU3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Sycp2Q9CUU3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
Sycp2Q9CUU3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Sycp2Q9CUU3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Sycp2Q9CUU3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Sycp2Q9CUU3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Sycp2Q9CUU3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Sycp2Q9CUU3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC40.14■■■■■ 4.02
Sycp2Q9CUU3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC40.14■■■■■ 4.02
Sycp2Q9CUU3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
Sycp2Q9CUU3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms